越橘SSR反应体系的优化
文献类型: 中文期刊
第一作者: 崔建民
作者: 崔建民;杨忠;邹荣仟;李亚东;温景辉;赵爽
作者机构:
关键词: 越橘;SSR;反应体系;优化
期刊名称: 吉林农业大学学报
ISSN: 1000-5684
年卷期: 2009 年 31 卷 05 期
页码: 32-37
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: 以"美登"、"北春"、"蓝丰"为试材,用TIANGEN植物基因组试剂盒提取基因组DNA,对SSR反应体系中的Mg2+浓度、dNTPs浓度、TaqDNA聚合酶用量、引物浓度、DNA模板浓度以及引物CA344F的退火温度进行了优化筛选,探讨了越橘SSR技术中PCR反应体系的主要成分对扩增结果的影响。确定了适合越橘的SSR反应体系:在20μL反应体系中,Mg2+2.0mmol/L,dNTPs0.20mmol/L,TaqDNA聚合酶0.5U,引物浓度0.8μmol/L,DNA模板1.5ng/μL;引物CA344F的最佳退火温度为58℃。利用此反应体系对部分越橘品种进行PCR扩增并用6%非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳检测,扩增结果清晰且DNA谱带多态性丰富,表明该体系稳定可靠,适合越橘的亲缘关系分析。
分类号: S663.9
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