利用小RNA深度测序技术鉴定上海地区'红美人'柑橘病毒种类

文献类型： 中文期刊

第一作者： 张丽勍

作者： 张丽勍;管丽琴;蒋飞;方献平;李水根;张学英

作者机构：

关键词： 柑橘;小RNA深度测序;病毒鉴定

期刊名称： 植物保护

ISSN： 0529-1542

年卷期： 2021 年 006 期

页码： 102-108,114

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为明确上海地区‘红美人’柑橘的病毒种类,2020年4月在崇明、金山、奉贤、嘉定、闵行和浦东采集疑似病毒感染的叶片样品11份,采用小RNA深度测序技术结合RT-PCR对不同来源的混合样品进行病毒种类鉴定。结果表明,样品中含有柑橘衰退病毒Citrus tristeza virus（CTV）、柑橘黄化脉明病毒Citrus yellow vein clearing virus（CYVCV）、柑橘树皮裂纹类病毒Citrus bark cracking viroid（CBCVd）和柑橘类病毒ⅤCitrus viroid V（CVd-Ⅴ）。同时发现,上海地区‘红美人’柑橘病毒复合侵染现象普遍。基于CTV和CYVCV的CP全长基因及CBCVd和CVd-Ⅴ全基因组序列系统进化分析结果表明:除了CYVCV的分离物与地理来源具有明显的相关性外,其余病毒及类病毒均没有严格的地域相关性。研究结果为开展‘红美人’柑橘种苗病毒检测及病毒病的防治奠定基础。

分类号： S436.66

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