'枸头'橙针刺和枝的转录组分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 孙立方

作者： 孙立方;柯甫志;聂振朋;王平;孙建华;黄秀;徐建国

作者机构：

关键词： '枸头'橙;针刺;枝;转录组分析;差异表达基因

期刊名称： 分子植物育种

ISSN： 1672-416X

年卷期： 2020 年 019 期

页码： 6290-6297

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 柑橘枝干多具针刺,造成树冠管理困难,增加果实机械伤害,给果实采收也带来不便,对生产不利.但是,目前柑橘针刺发育和调控的分子机制尚不清楚,也无相关报道.本研究以'枸头'橙(Citrus aurantium L. cv.'Goutou'Cheng)为研究材料,利用高通量测序平台Illumina HiSeq X Ten对针刺和枝进行了转录组测序.测序数据初步分析后共筛选到5 441个差异表达基因,其中包含上调表达基因2 881个、下调表达基因2 560个.GO富集结果表明差异表达基因主要集中在生物过程(3 170个基因)、代谢过程(2 396个基因)、单生物过程(1 742个基因)、氧化还原酶活性(520个基因)和结合活性(359个基因)等.差异表达基因KEGG代谢通路富集分析表明,富集程度比较显著的通路包括:次生代谢物生物合成(271个基因)、植物激素信号转导(73个基因)和苯丙素生物合成(55个基因)路径.其中,KEGG代谢通路富集分析结果表明次生代谢物合成的差异可能是针刺和枝的发育不同的重要因素,也暗示着次生代谢物合成路径可能在针刺发育过程起关键调控作用.本研究对枸头橙针刺和枝进行转录组测序并比较分析,为后期筛选柑橘针刺发育调控的关键基因和深入研究其分子调控机制提供了科学基础.

分类号： S666.4

  • 相关文献

[1]采用UPLC-MS/MS技术分析‘枸头橙’针刺和枝代谢物. 孙立方,柯甫志,聂振朋,王平,孙建华,徐建国. 2020

[2]旱柳转录组测序及生物学分析. 李敏,郭聪,李玉娟,冯新民,王莹,张健,谈峰. 2019

[3]脊尾白虾对低盐胁迫响应的转录组学分析. 沈晔,王兴强,曹梅,郑年昊,陈百尧,秦传新. 2020

[4]睡莲叶片胎生发育转录组分析. 苏群,田敏,李春牛,李先民,卢家仕,黄展文,李杰梅,卜朝阳,王虹妍. 2021

[5]利用转录组分析茉莉酸甲酯对金针菇原基生长的影响. 李玉,朱秋瑾,李巧珍,陆欢,王瑞娟,杨慧,尚晓冬,刘建雨. 2022

[6]高粱窄叶突变体nal1表型鉴定及转录组分析. 刚爽,张世睿,陆晓春,高梽鑫,李金红. 2023

[7]高代自交系茄子CR耐低温生理特性及转录组学分析. 宋雪,李冰,张敬敬,高秀瑞,潘秀清,武彦荣. 2023

[8]出芽短梗霉菌株PA-2侵染藜叶片的转录组分析. 刘晓芳,杨莹,高汉峰,程亮,朱海霞,郭青云. 2023

[9]杜鹃花品种大鸳鸯锦花瓣条纹形成的色素基础和差异表达基因的挖掘. 孙晓波,郭臻昊,李畅,周惠民,刘晓青,苏家乐. 2023

[10]茄子耐低温性差异材料的筛选及其转录组分析. 朱宗文,吴雪霞,张爱冬,查丁石. 2021

[11]自然状态下小叶锦鸡儿、梨、枣、桃芽、叶、枝中甜菜碱含量的比较. 郭世军,牛宇,宋志辉,郜春花,周怀平,牛西午. 2008

[12]枣果实生长发育期枝条 主要矿质元素含量的变化规律. 李春燕,卢桂宾,刘和,郭晓东,刘英翠. 2019

[13]天山北麓酿酒葡萄倾斜式双蔓双臂树形培养技术. 马占胜,杨坚,宋晓辉,张付春. 2021

[14]针药结合治疗带状疱疹45例疗效观察. 吴文锋. 2007

[15]针刺麻醉机制研究进展. 王贵波,罗超应,郑继方,李锦宇,王东升,丁明星. 2010

[16]丹红注射液联合克林澳配合针刺治疗急性脑梗死疗效观察. 陈影霞,李银娣,蔡小玲. 2015

[17]针刺麻醉机制研究. 王贵波,国程,丁明星,郑继方,罗超应. 2011

[18]猪外周血液中β-内啡肽与针刺免疫. 孟宪松,史计署,唐丽萍,张为民,王明,马思奇,周金发,崔现兰,任民峰,杨惠芳. 1992

[19]基于RNA-Seq技术的盐胁迫向日葵转录组信息分析. 孙瑞芬,张艳芳,郭树春,于海峰,李素萍,聂惠,乔慧蕾,安玉麟. 2015

[20]玉米矮秆突变体A2的表型鉴定及转录组分析. 董春林,翟广谦,张正,杨睿,张明义,张彦琴,杨丽莉,常建忠. 2019

作者其他论文 更多>>

微信小程序