普通菜豆基因组SSR标记开发及在豇豆和小豆中的通用性分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 陈明丽

作者： 陈明丽;王兰芬;武晶;张晓艳;杨广东;王述民

作者机构：

关键词： 普通菜豆;豇豆属;SSR标记;通用性

期刊名称： 作物学报

ISSN： 0496-3490

年卷期： 2014 年 40 卷 05 期

页码： 924-933

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 分子标记具种属间通用性可提高其利用效率,并降低标记开发成本。本研究基于Roche 454超高通量测序技术获得普通菜豆基因组测序结果,共开发了560个普通菜豆基因组SSR标记。利用2份普通菜豆品种对标记进行初步筛选,有421个标记能够有效扩增。用新开发的标记分析16份豇豆和16份小豆的通用性。结果显示,185个普通菜豆基因组SSR标记在豇豆中能有效扩增,通用性比率为43.9%;161个SSR标记在小豆中能有效扩增,通用性比率为38.2%;在豇豆和小豆中都能获得有效扩增条带的标记共138个;并且普通菜豆基因序列SSR标记在豇豆和小豆中的通用性比率高于基因间序列SSR标记。通用性标记的多态性分析表明,豇豆和小豆的多态性比率分别为34.0%和24.8%;且豇豆和小豆中基因间标记的多态性都比基因内标记的多态性高。上述通用性标记为豇豆属作物的多样性评价、连锁图谱的构建及基因定位等方面的研究提供了便利。

分类号： Q943.2

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