辣椒不同发育时期果实着色的转录组分析
文献类型: 中文期刊
第一作者: 秦于玲
作者: 秦于玲;申龙斌;曹振木
作者机构:
关键词: 辣椒果实;RNA-Seq;类胡萝卜素;转录因子
期刊名称: 分子植物育种
ISSN: 1672-416X
年卷期: 2020 年 017 期
页码: 5576-5583
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: 为研究辣椒果实不同发育时期着色的基因表达差异,探究参与或调控辣椒果实类胡萝卜素合成的基因或转录因子.本研究采用RNA-Seq技术对辣椒果实青果期(G)、转色期(B1,果实表面30%左右变色)、转色期(B2,果实表面50%左右变色)和成熟期(R)的辣椒果实进行了转录组测序分析.结果表明,G-vs-B1、B1-vs-B2和B2-vs-R上调和下调的差异表达基因(DEGs)分别为924个和2 188个;DEGs经GO富集分析主要集中在生物调控、应激反应、信号、代谢过程和生长等的生物过程;DEGs经KEGG富集分析主要富集在类胡萝卜素生物合成和淀粉、蔗糖代谢等信号通路,DEGs共注释到3 079个转录因子,包括AP2、MYB、MADS和ERF等类型,转录因子AP2在调控植物类胡萝卜素的生物合成方面已得到证实,但在辣椒果实着色过程中的作用还有待研究.本研究为进一步挖掘辣椒果实着色过程中的关键调控因子,解析调控类胡萝卜素生物合成提供理论基础.
分类号: S641.3
- 相关文献
[1]利用RNA-Seq技术鉴定拟南芥不定芽再生相关的转录因子. 王兴春,陈钊,樊娟,何苗苗,韩渊怀,杨致荣. 2015
[2]本生烟响应蛋白激发子PevD1的差异表达基因鉴定与分析. 梁颖博,李泽,邱德文,曾洪梅,李广悦,杨秀芬. 2019
[3]盐胁迫条件下花生应答转录因子鉴定与分析. 秦圣豪,韩燕,崔凤,刘译阳,万书波,李国卫. 2018
[4]柚芽变株系类胡萝卜素代谢差异基因的转录组学分析. 潘鹤立,潘腾飞,佘文琴,徐世荣,李小婷,黄汉唐,陈源,吴少华,潘东明. 2020
[5]辣椒果实类胡萝卜素调控因子转录组和靶向代谢组分析. 段敏杰,李怡斐,王春萍,杨小苗,黄任中,黄启中,张世才. 2024
[6]大蕉果实转录组学分析及类胡萝卜素合成相关基因的研究. 韩树全,罗立娜,魏鹏程,卢振亚,贺尔奇,刘凡值. 2024
[7]不同熟期辣椒果实农艺性状和维生素C含量动态变化. 冯营,胡新燕,冯清伟,孙亚伟,李卫华. 2015
[8]辣椒果实生长发育动态的研究. 吴雪霞,薛林宝,陈建林,朱为民. 2005
[9]不同节位辣椒品质成分比较分析. 阮美颖,高成安,方明雅,姚祝平,叶青静,万红建,周国治,王荣青,程远. 2022
[10]李宝聚博士诊病手记(七十六) 辣椒炭疽病的诊断与防治. 王莹莹,张自心,谢学文,郭现坤,晋知文,韩之琪,李宝聚. 2014
[11]LED光质对辣椒果实色泽品质的影响. 杨奇,谢小玉,李清明,郑胤建. 2024
[12]李宝聚博士诊病手记(七十六)辣椒炭疽病的诊断与防治. 王莹莹,张自心,谢学文,郭现坤,晋知文,韩之琪,李宝聚. 2014
[13]UV-B辐射对不同发育时期辣椒主要果实品质的影响. 陈艳,张文娟,邓昌蓉,侯全刚,刘敏,邵登魁. 2023
[14]取食番茄、辣椒和人工饲料对斜纹夜蛾生长发育和繁殖力的影响. 严珍,吕宝乾,彭正强,章程辉,金启安,温海波. 2013
[15]李宝聚博士诊病手记(十)辣椒灰霉病的新症状. 李宝聚,赵彦杰. 2009
[16]基于RNA-Seq技术的盐胁迫向日葵转录组信息分析. 孙瑞芬,张艳芳,郭树春,于海峰,李素萍,聂惠,乔慧蕾,安玉麟. 2015
[17]基于RNA-Seq技术的谷子新基因发掘及基因结构优化. 穆彩琴,张瑞娟,屈聪玲,韩渊怀,王兴春. 2016
[18]基于RNA-Seq的稻瘟病菌Δznf1突变体的表达谱分析. 岳晓凤,阙亚伟,王政逸. 2016
[19]基于RNA-seq技术开发中间偃麦草基因组特异分子标记. 崔雨,鲍印广,王洪刚,李兴锋. 2016
[20]芸薹根肿菌侵染早期甘蓝型油菜转录组分析. 罗延青,王云月,俎峰,符明联,赵凯琴,张云云,王敬乔,田正书,陈苇,李劲峰,原小燕,李根泽. 2019
作者其他论文 更多>>
-
124份黄秋葵种质资源表型性状多样性分析
作者:朱丹;刘子记;秦于玲;殷晓敏;王现丽;刘维侠
关键词:黄秋葵;表型性状;遗传多样性;主成分分析;聚类分析
-
海南本地抗病小米辣响应象耳豆根结线虫侵染的miRNA鉴定及其靶基因预测
作者:高畅;张志远;刘子记;陈梅红;朱婕;曹振木
关键词:灌木辣椒;抗象耳豆根结线虫;sRNA测序;miRNA;靶基因
-
玉米DIR基因家族的全基因组鉴定及ZmDIR17基因在籽粒发育中的功能解析
作者:秦涛;王慧;赵志雄;申龙斌;史亚兴;卢柏山;施标;郑洪建
关键词:玉米;DIR基因家族;ZmDIR17基因;籽粒发育
-
辣椒果实SGR基因的克隆与功能分析
作者:秦于玲;刘维侠;曹振木;刘琳;朱丹;殷晓敏;刘子记
关键词:辣椒;CaSGR基因;VIGS技术;叶绿素;β-胡萝卜素
-
基本科研业务费创新管理对项目绩效的影响研究
作者:刘永花;申龙斌;刘少姗;徐熠瑞;陈丽珍;唐弼
关键词:基本科研业务费;创新管理;项目绩效;回归分析
-
海南省现代农业产业技术体系构建
作者:秦涵淳;楚小强;林培群;徐雪莲;魏玉云;陈业渊;申龙斌
关键词:现代产业技术体系;建设现状;产业协作;海南省建议
-
辣椒种质资源PMMoV抗性基因检测与抗性鉴定
作者:陈建分;曹振木;秦于玲;申龙斌;刘维侠;朱丹;吴怡婷;刘子记;王旭
关键词:辣椒;种质资源;PMMoV;分子标记;抗病性鉴定
