烟草CBF基因全基因组鉴定及响应低温胁迫表达分析
文献类型: 中文期刊
第一作者: 隋晓燕
作者: 隋晓燕;胡日生;晏伟杰;易鹏飞;杨晨凯;杨佳蒴;户正荣;刘旦;周志成;李洋洋
作者机构:
关键词: 烟草;CBF基因家族;低温胁迫;基因表达
期刊名称: 分子植物育种
ISSN: 1672-416X
年卷期: 2023 年 21 卷 003 期
页码: 799-808
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: CBF(C-repeat binding factor)基因在植物响应低温等非生物胁迫过程中发挥着重要作用.为研究普通烟草(Nicotania tabacum)CBF与低温胁迫的关系,本研究利用生物信息学方法,在普通烟草基因组中鉴定获得19个NtCBF基因,对NtCBF的基因与蛋白结构、系统进化、启动子顺式作用元件和低温胁迫前后的基因表达进行了分析.结果表明,19个NtCBF蛋白分子量为20.51~28.20 kD,均包含AP2/ERF(Apetala2/ethylene responsive factor)结构域和CBF基因的特征基序.系统进化分析表明,19个NtCBF基因可分为两组,分别包含12和7个NtCBF基因.启动子元件分析对NtCBF响应激素和非生物胁迫的顺式作用元件进行了预测.低温处理前后的基因表达分析表明,11个NtCBF基因在低温胁迫1 h内显著上调,推测与烟草响应低温胁迫有关.本研究系统鉴定了普通烟草CBF基因,发现11个NtCBF基因受低温诱导表达,为烟草耐低温研究积累了基础数据.
分类号: S572
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