2011年~2012年G9型猪轮状病毒流行病学调查及VP7基因遗传进化分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 王璐

作者： 王璐;时洪艳;陈建飞;张鑫;史楠;石达;刘随新;张莎;冯力

作者机构：

关键词： 轮状病毒;VP7基因;G9;遗传变异

期刊名称： 中国预防兽医学报

ISSN： 1008-0589

年卷期： 2013 年 35 卷 4 期

页码： 276-279

收录情况： CSCD

摘要： 为分析G9型猪轮状病毒(RV)的遗传变异情况,本研究根据GenBank中VP7序列设计合成一对扩增VP7基因的引物,采用PCR方法对2011年~2012年分离的部分RV VP7基因进行扩增、克隆和序列测定,并进行比对和遗传进化分析。结果表明:531份病料中RV阳性份数为39,阳性率为7.34%;而在检测的121个猪场中,共有23个猪场显示阳性,猪场阳性率为19%。VP7基因全长1 062 bp,含有一个982 bp的开放阅读框,编码326个氨基酸。与参考病毒株VP7全长基因核苷酸比较,同源性为91.5%~99.3%。在31 nt、56 nt、75 nt、82 nt、191 nt、215 nt等位置均存在点突变,无插入和缺失。核苷酸系统发育进化树表明:黑龙江省哈尔滨市、桦南、绥化,辽宁省大连市、内蒙古自治区采集病料样品的基因间差异较小,与采集自中国广西、浙江、贵州、北京的病料样品基因相比差异性较大,这表明VP7基因存在地域差异。

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