鸽圆环病毒全基因组测序及遗传进化分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 王仲浩

作者： 王仲浩;田野;袁小远;李桂明;陈书民;刘明超;王传文;孟凯

作者机构：

关键词： 鸽圆环病毒;全基因组测序;遗传进化分析

期刊名称： 中国畜牧兽医

ISSN： 1671-7236

年卷期： 2025 年 52 卷 011 期

页码： 5414-5421

收录情况： 北大核心

摘要： [目的]了解华东部分地区流行的鸽圆环病毒(Pigeon circovirus,PiCV)基因组特征及遗传变异规律.[方法]无菌采集58只病死鸽的肺脏、脾脏、肝脏组织,利用PCR扩增进行病原检测.对PiCV阳性样本通过PCR扩增病毒基因组全长并进行TA克隆.阳性质粒测序结果通过DNAStar和Mega 11.0软件进行全基因组序列拼接以及核苷酸、氨基酸序列比对,并构建系统进化树.利用RDP 5.42和Simplot 3.5.2软件对分离株进行重组分析并鉴定.[结果]PCR检测结果显示,58只病死鸽中检出30只PiCV阳性,且其他病毒未检出.测序结果显示,成功获得5株PiCV全基因组序列,分别命名为SD02、SD040、JS091、AH056和AH529,序列长度分别为2 037、2 034、2 039、2 039和2 041 bp.相似性比对结果显示,5株PiCV分离株与国内外参考株核苷酸序列相似性为83.2%~100%,与国内的分离株亲缘关系更近.遗传进化分析结果显示,5株PiCV分离株属于不同亚型,分离株SD040、SD02、JZ091、AH056、AH529分别属于B、A、C、G和H亚型.氨基酸序列分析表明,5株PiCV分离株与标准株jz1相比,Cap蛋白氨基酸出现不同程度的突变、替换和缺失,Rep蛋白存在3个氨基酸位点缺失和1个氨基酸位点突变.重组分析表明,5株PiCV分离株有2个重组事件被鉴定,其中分离株AH056是由GX6株和JS2株重组产生,重组断点位于161 bp处.[结论]本研究分离获得5株不同亚型PiCV全基因组序列.病毒重组及关键蛋白突变为其多样性和复杂性的重要成因.本研究丰富了对PiCV基因组特征及遗传演化规律的认识,为华东地区PiCV的防控提供了重要参考依据.

分类号： S855.3

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