汾远2号远志的rDNA ITS等位基因特异性PCR鉴别研究

文献类型： 中文期刊

第一作者： 李娟

作者： 李娟;王丹丹;孔冉冉;田洪岭;张福生;秦雪梅;马存根

作者机构：

关键词： 远志;汾远2号;ITS;等位基因特异性引物;分子鉴别

期刊名称： 山西医科大学学报

ISSN： 1007-6611

年卷期： 2019 年 08 期

页码： 1143-1148

摘要： 目的设计出鉴别汾远2号远志的特异性PCR引物,建立快速鉴别汾远2号远志的方法。方法利用植物核糖体DNA(r DNA)的内部转录间隔区(internal transcribed spacer,ITS)通用型引物扩增远志样品,并对所有样品进行双向测定,采用DNAMAN软件对远志样品r DNA ITS序列进行比对,找到汾远2号远志(Polygala tenuifolia,简称FY2)的等位基因差异位点,并利用NCBI网上已有的远志序列以及作者测序得到的卵叶远志(P. sibirica)序列和FY2序列比对,进行等位基因差异位点的验证。最后根据FY2的碱基差异位点,采用Primer 5. 0软件设计特异性PCR引物,用于FY2的特异性PCR鉴别。结果测序所得的序列与NCBI中远志的相似度高达99. 36%。找到了两个FY2的等位基因差异位点,第123位点为T,其余样品均为A,第553位点为T,其余样品均为C。设计了4对特异性PCR引物对FY2进行特异性PCR扩增,在约463 bp处出现单一的扩增条带,而其他远志及卵叶远志则无相应的扩增条带。结论等位基因特异性PCR能有效地从远志和卵叶远志药材中鉴别出汾远2号远志,具有准确、高效、灵敏、简便的特点。

分类号： R282.5

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