甜瓜STP家族基因鉴定与生物信息学分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 封雨晴

作者： 封雨晴;孙建磊;董玉梅;刘鹏;王崇启;焦自高;高超;韩德果

作者机构：

关键词： 甜瓜;STP家族基因;生物信息学分析;系统进化分析

期刊名称： 中国蔬菜

ISSN： 1000-6346

年卷期： 2025 年 009 期

页码： 54-63

收录情况： 北大核心

摘要： 糖转运蛋白（sugar transporter proteins,STPs）作为一类重要的单糖转运蛋白，在植物各个生长发育阶段起着重要作用。本研究利用生物信息学方法，对甜瓜STP家族基因进行鉴定，并对该家族基因的染色体定位、基因结构、进化关系、共线性关系、启动子序列、组织表达等进行了分析。结果表明，甜瓜STP基因家族包括18个基因，依次命名为CmSTP1～CmSTP18，在除1、3、10和11号染色体外的8条染色体上不均匀分布。18个基因均含有内含子，且大部分含有3个。在系统进化树中，18个甜瓜STP基因家族被划分为3个类群；共线性分析表明，甜瓜与番茄存在共线性关系的基因共13对，与拟南芥存在共线性关系的基因共7对；启动子分析鉴定到多种激素以及光响应等顺式作用元件。组织表达分析结果显示，12个CmSTP组织特异性表达，表明不同CmSTP在甜瓜的不同组织或者不同的发育时期发挥重要的功能。研究结果为进一步探究STP基因家族在调控甜瓜植株生长发育过程中的功能奠定了基础。

分类号： S652

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