长毛兔粗、细毛毛囊转录组比较分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 王源朗

作者： 王源朗;丁海生;齐平平;赵辉玲;黄冬维

作者机构：

关键词： 长毛兔;毛囊;纤维直径;RNA-seq;蛋白互作

期刊名称： 中国农业大学学报

ISSN： 1007-4333

年卷期： 2025 年 30 卷 001 期

页码： 142-152

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为筛选出影响兔毛纤维直径的相关基因及调控通路，本研究采用RNA测序（RNA-seq）鉴定长毛兔粗、细毛毛囊中差异表达的基因，并进行差异基因（DEGs）功能富集分析。通过Cytoscape构建蛋白互作网络，筛选出核心基因，最后采用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)对差异表达基因进行验证。结果表明：1)RNA-seq共鉴定了412个DEGs，相比粗毛毛囊，160个DEGs在细毛毛囊上调表达，252个DEGs下调表达。2)GO功能富集分析显示，差异基因显著富集到330个条目中，包括蜕皮周期、发周期、毛发周期的调节、超分子纤维等与粗、细毛生长相关的条目；KEGG富集分析表明差异表达基因显著富集在雌激素信号通路、蛋白质消化和吸收、内质网中的蛋白质加工途径、PPAR信号通路、FoxO信号通路和基底细胞癌等与长毛兔粗、细毛生长分化有关的信号通路中。3）蛋白互作网络分析表明SHH、LGR5、CTSB、ACTA2和CRNN等是调控毛纤维结构的重要功能基因。综上，本研究鉴定了调控兔毛直径的差异表达基因，挖掘出5个与长毛兔粗、细毛分化相关的候选基因，为细毛型长毛兔的选育提供理论依据和数据支撑。

分类号： S829.1

  • 相关文献

[1]基于转录组测序研究调控黄羽肉鸡干毛性状关键基因和信号通路. 姬改革,陈智武,单艳菊,刘一帆,屠云洁,邹剑敏,章明,巨晓军,束婧婷,张海涛,唐燕飞,蒋华莲. 2024

[2]鄂尔多斯细毛羊羊毛细度和皮肤转录组测序分析. 祁云霞,付绍印,何小龙,王标,达赖,特日格勒,陶萨茹拉,丹巴,刘永斌. 2015

[3]不同细度类型细羊毛纤维直径变异研究. 狄江,李勇,拉扎提,李武臣,陈为江. 2007

[4]EEF1D基因表达对绵羊羊毛纤维直径和毛囊发育的影响. 张敏,杨华,魏巧兰,何高明,沈敏. 2023

[5]不同温湿度环境对细羊毛纤维直径检测结果的影响. 李宗欣,郑文新,邢魏婷,吕雪峰,张敏,胡昕,范彬彬,全凯丽,刘建新. 2024

[6]红麻纤维线密度快速检测方法研究. 杨喜爱,肖爱平,冷鹃,程毅,廖丽萍,孙向平. 2015

[7]绵羊皮肤转录组denove组装及其特征. 岳耀敬,冯瑞林,王天翔,郭婷婷,李桂英,孙晓萍,刘建斌,李文辉,牛春娥,郭健,李范文,杨博辉. 2015

[8]遗传改良提高个体羊毛生产效益研究进展. 玛尔孜亚·亚森,蒋晓梅,拉扎特·艾尼瓦尔,古丽格娜,别克火加·库齐尔拜,于丽娟,买坎·沙力,张艳花. 2019

[9]西藏绒山羊WNT4和HOXC13基因对绒毛纤维直径性状的遗传效应分析. 吴玉江,付雪峰,索朗达,巴贵,德吉,次仁德吉,宋天增,田可川. 2020

[10]不同羊毛纤维直径细毛羊皮肤组织差异表达基因研究. 狄江,拉扎提·艾尼瓦尔,徐新明,张艳花,田可川,田月珍,吴伟伟,于丽娟,哈尼克孜·吐拉甫. 2013

[11]亚麻纤维线密度与直径回归相关模型的构建及验证. 杨喜爱,肖爱平,冷鹃,程毅,廖丽萍. 2014

[12]绵羊KAP1.1基因多态性与毛纤维直径的相关性分析. 宋天增,杨华,徐从祥,杨剑波,韩猛立,杨永林,石国庆. 2012

[13]新疆羊驼毛纤维直径与单纤维强力的回归分析. 张敏,陈华峰,郑文新,王乐,胡昕,库木斯·哈布多拉,阿依古丽·玉苏甫,高扬. 2021

[14]羊毛细度性状主观评定和客观检测对比分析. 朱桦,徐新明,田可川,黄锡霞,柏妍,赵冰茹,田月珍,付雪峰,吴伟伟,何军敏. 2018

[15]凉山半细毛羊生长性能和羊毛品质研究. 何琴,许锋,毛比超,王建元,杨世忠,刘火石铁,朱元祥,俄木曲者. 2023

[16]IRF2BP2基因与绵羊被毛类型和纤维直径的相关性研究. 谢梦婉,李忠慧,李文蓉,田月珍,张彦威,唐丽苹,郑培宇,宋楠楠,于丽娟,狄江. 2024

[17]加拿大一枝黄花喂兔试验. 许建伟,陈世芳,蒋永清,郑会超,黄新. 2009

[18]兔舍小环境控制对长毛兔生长繁殖性能的影响. 贾玉堂,汤继顺,窦长坤,李立冰,谷卫群,徐智明. 2009

[19]提高家兔成活率的关键措施(上). 侯明海. 2006

[20]不同采毛方式对长毛兔部分血清生化指标的影响. 黄冬维,陈胜,赵小伟,程广龙,杨永新,徐建,赵辉玲. 2013

作者其他论文 更多>>

微信小程序