马铃薯TIR1基因的电子克隆与生物信息学分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 王晓娇

作者： 王晓娇;逯春杏;许飞;刑晓东;孙秀云;曹春梅

作者机构：

关键词： 马铃薯;TIR1;电子克隆;生物信息学;亚细胞定位

期刊名称： 分子植物育种

ISSN： 1672-416X

年卷期： 2025 年 23 卷 017 期

页码： 5665-5671

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 植物运输抑制响应蛋白1(transport inhibitor protein 1, TIR1)是一种生长素受体，在生长素信号转导过程中发挥重要作用。目前有关马铃薯生长素受体基因的研究尚未见报道。本研究是从前期工作中获得EST序列，利用NCBI中的BLAST工具，对原始序列进行同源性分析，选择与原始序列相似度最高的一条同源序列。通过电子克隆技术，得到TIR1基因。采用生物信息学方法对基因序列、编码氨基酸、理化性质、跨膜结构域、亲/疏水性、信号肽、磷酸化位点、N-端糖基化位点、高级结构等进行分析。结果表明，TIR1基因cDNA全长1 740 bp，编码580个氨基酸，分子量64.68 kD，理论等电点5.60，亲水性系数0.034，不稳定系数56.67，为不稳定酸性疏水性蛋白，编码蛋白含有59个磷酸化位点，4个N-端糖基化位点，无信号肽、跨膜区域，高级结构主要由α螺旋和无规卷曲序列组成。通过系统进化分析，TIR1蛋白与烟草、番茄和拟南芥等植物中的TIR1蛋白同源性较高。亚细胞定位分析，TIR1基因主要位于细胞核，小部分可能位于线粒体。研究结果为马铃薯TIR1基因的试验克隆及功能验证研究提供了理论依据。

分类号： S532

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