艾纳香脱氢酶基因家族的生物信息学分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 白琳

作者： 白琳;官玲亮;查英;于福来;王凯;谢小丽;庞玉新;陈松笔

作者机构：

关键词： 艾纳香;艾纳香脱氢酶(BbADH);氨基酸序列;保守区;系统发育分析

期刊名称： 热带作物学报

ISSN： 1000-2561

年卷期： 2020 年 41 卷 006 期

页码： 1145-1153

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 采用RT-PCR和RACE(Rapid amplification of cDNA ends)技术,从艾纳香(Blumea balsamifera(L.)DC.)叶片中克隆到4条编码艾纳香脱氢酶(BbADH1、BbADH2、BbADH3、BbADH4)基因的cDNA序列,并对4条核苷酸及其编码的氨基酸序列进行生物信息学分析.结果显示:4条艾纳香脱氢酶序列开放阅读框均在900 bp左右,蛋白质等电点(pI)值在5.0~9.0之间,含量最多的氨基酸为亮氨酸(Leu),最少的为色氨酸(Try),具有明显的疏水区和亲水区,N端未发现信号肽,且无跨膜区;同源性比对结果显示,艾纳香BbADH蛋白与其他植物中ADH蛋白具有高度的相似性,且具有脱氢酶的特征功能域;系统发育分析表明,艾纳香(B.balsamifera(L.)DC.)BbADH1和BbADH3同处于一个分支,且与胡杨(Populus euphratica Oliv.)PeADH物种亲缘关系较近,而艾纳香BbADH4和BbADH2处于不同分支,且分别与葡萄(Vitis vinifera)VvADH和烟草(Nicotiana tabacum)NtADH物种亲缘关系较近.

分类号： Q78

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