紫叶紫薇新品系叶色变化转录组分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 王莹

作者： 王莹;李玉娟;李敏;马祥建;谈峰;郭聪;张健

作者机构：

关键词： 紫叶紫薇;叶色变化;转录组

期刊名称： 江苏农业学报

ISSN： 1000-4440

年卷期： 2018 年 005 期

页码： 1128-1137

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 对紫叶紫薇新品系的叶片进行RNA-Seq测序和分析,共获取145 338条Contig,得到组装的Unigene有53 654条,平均长度1 186.25 bp.32 667条Unigene可以匹配到蛋白质数据库获得注释信息,KEGG和GO注释与富集分析显示,差异DEG主要调节激素信号转导、碳水化合物代谢、核糖体代谢等生物学功能.58个表达差异基因分别对比到毛果杨和拟南芥2个模式植物的数据库,筛出与叶绿素代谢相关候选基因9个,其中2个候选基因共同参与了叶绿素兼类黄酮代谢的调控,2个候选基因可能参与类黄酮代谢过程,它们分别属于DUF547、Polyketidecyc2、Pkinase、Calreticulin、NADGly3PdhN、Glycohydro9等13个基因家族,主要经氧化还原反应、物质能量代谢、植物激素信号转导等机制介入紫薇叶色调控.本研究结果为探究紫叶紫薇叶色变异的分子机制提供参考.

分类号： S687

  • 相关文献

[1]紫叶紫薇新品系叶色变化转录组分析. 王莹,李玉娟,李敏,马祥建,谈峰,郭聪,张健. 2018

[2]紫叶紫薇新品系叶色变化理化因素研究. 王莹,李敏,谈峰,马祥建,郭聪,李玉娟. 2018

[3]美国红枫叶片转录组分析. 郭聪,王莹,谈峰,陈燕,李玉娟. 2020

[4]不同生根剂对美国紫叶紫薇扦插的影响. 王莹,李玉娟,李敏,张远,谈峰,张健. 2017

[5]洒金柏色素变化及光合作用响应特征. 廖婷,付琳,郭丽琴,刘国彬,王烨,姚砚武,曹均. 2021

[6]遮阴对紫叶紫薇幼苗生长及光合特性的影响. 马晓华,张旭乐,章彦君,胡青荻,钱仁卷,郑坚,汤真勇. 2023

[7]基于高通量测序的青花菜早期发育小孢子转录组分析与基因功能注释. 张振超,姚悦梅,毛忠良,孙国胜,秦文斌,戴忠良. 2018

[8]基于RNA-Seq技术的谷子新基因发掘及基因结构优化. 穆彩琴,张瑞娟,屈聪玲,韩渊怀,王兴春. 2016

[9]转录组测序(RNA-seq)策略及其数据在分子标记开发上的应用. 李小白,向林,罗洁,胡标林,田胜平,谢鸣,孙崇波. 2013

[10]黄瓜共表达基因模块的识别及其特点分析. 林行众,张忠华,杨清,黄三文. 2015

[11]海带转录组SSR序列特征及其相关基因功能分析. 李秋莹,张杰,姚建亭,王秀良,段德麟. 2016

[12]基于玛氏骨条藻转录组的脂肪酸合成途径分析. 张梅,米铁柱,甄毓,王华龙. 2018

[13]感染球孢白僵菌的家蚕免疫应答差异表达基因分析. 侯成香,覃光星,耿涛,高坤,潘中华,钱荷英,郭锡杰. 2014

[14]拟南芥不定芽发生早期的数字基因表达谱分析. 王兴春,杨致荣,张树伟,李红英,李生才. 2013

[15]基于RNA-Seq技术的鲮转录组分析. 许建,赵建,徐礼鸣,崔军,李强,朱新平,徐鹏. 2014

[16]基于新一代测序技术的昆虫转录组学研究进展. 张棋麟,袁明龙. 2013

[17]模拟干旱对甘薯近缘野生种[Ipomoea trifida(Kunth) G. Don]生理特性和基因表达谱的影响. 王娇,李雪华,戴习彬,成小威,孙健英. 2017

[18]马铃薯转录组EST-SSR挖掘及其多样性分析. 巩檑,程永芳,甘晓燕,陈虞超,聂峰杰. 2015

[19]基于RNA-seq数据的小麦条锈菌SSR标记开发. 刘秀峰,许静杨,袁文娅,梁丹,时晓伟. 2018

[20]基于玛氏骨条藻(Skeletonema marinoi)转录组的碳固定代谢途径分析. 刘乾,米铁柱,甄毓,王华龙,于志刚. 2016

作者其他论文 更多>>

微信小程序