胶孢炭疽菌侵染不同抗性葡萄叶片的转录组学分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 沈才琦

作者： 沈才琦;孙磊;张颖;姜建福;刘崇怀;樊秀彩

作者机构：

关键词： 葡萄炭疽病;转录组;胶孢炭疽菌;差异表达基因

期刊名称： 果树学报

ISSN： 1009-9980

年卷期： 2022 年 05 期

页码： 730-742

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 【目的】通过转录组测序筛选葡萄由胶孢炭疽菌侵染引起的差异表达基因，以进一步分析葡萄抗炭疽病分子机制。【方法】用胶孢炭疽菌侵染不同抗性葡萄的叶片，以清水处理叶片为对照，设置0、24、48、72 h 4个时期取样。采用RNA-seq分析两者间的差异表达基因，挑选出抗病候选基因，并利用qRT-PCR进行验证。【结果】共对42个样品进行转录组测序，每个样品平均数据量为6.65 Gb。KEGG富集分析中差异表达基因主要集中在植物与病原体互作、类黄酮生物合成和MAPK信号途径；转录因子家族分析从MYB、AP2-EREBP、bHLH、NAC和WRKY家族中筛选出12个在抗病株系中高表达的差异表达基因；WGCNA得到抗病相关模块MEdarkgreen。综合各项分析，挑选出9个差异表达基因进行q RT-PCR验证，其中8个基因的表达趋势同转录组测序结果一致。【结论】获得了葡萄响应胶孢炭疽菌侵染的差异表达基因，显著富集在植物与病原体相互作用、类黄酮生物合成和MAPK信号途径等3个通路，并筛选出8个抗病候选基因，包括MLO蛋白，WRKY、ERF转录因子等。

分类号： S436.631.15

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