基于COⅠ基因分析7个罗非鱼群体的遗传变异
文献类型: 中文期刊
第一作者: 姜冰洁
作者: 姜冰洁;傅建军;朱文彬;王兰梅;方敏;董在杰
作者机构:
关键词: 罗非鱼;COⅠ基因;群体;遗传多样性
期刊名称: 上海海洋大学学报
ISSN: 1674-5566
年卷期: 2019 年 06 期
页码: 827-834
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: 为了研究罗非鱼群体的遗传多样性及其系统进化关系,以尼罗罗非鱼(Oreochromis niloticus)、奥利亚罗非鱼(O.aureus)、莫桑比克罗非鱼(O.mossambicus)、吉富罗非鱼(GIFT)和3种红罗非鱼(中国台湾红罗非鱼、马来西亚红罗非鱼、以色列红罗非鱼)7个群体为材料,对其线粒体细胞色素氧化酶亚基Ⅰ(COⅠ)的序列进行PCR扩增和序列比对,分析7个罗非鱼群体的遗传变异情况。在324个样品中检测出180个多态性位点和98个单倍型,平均单倍型多样性为0.944,核苷酸多样性为0.036。中性检验Tajima’s D值显示GIFT、莫桑比克罗非鱼和奥利亚罗非鱼群体在经历瓶颈效应和/或纯化选择后种群规模扩大。7个罗非鱼群体间的遗传距离为0.000~0.071,种群遗传分化指数(Fst)值为0.016~0.994。AMOVA分析显示,大多数遗传变异来自群体间(70.78%)。研究还发现,本实验中的奥利亚罗非鱼遗传多样性最低,其余6个群体的遗传多样性较丰富。利用COⅠ基因对7个罗非鱼群体的遗传结构进行分析,丰富了罗非鱼种群特别是红罗非鱼的遗传背景数据,对其种质资源利用具有一定的指导意义。
分类号: S917.4
- 相关文献
[1]基于COⅠ基因研究钱塘江三角鲂亲本、放流和自然捕捞群体的遗传多样性与遗传分化. 王邢艳,徐东坡,张婉平,童奇烈,方弟安,周彦锋,张敏莹. 2021
[2]基于COⅠ基因序列的东、黄海区野生与养殖大黄鱼遗传多样性分析. 谌微,张凤英,王景,魏鸿擎,姜亚洲,张辉,凌建忠,程家骅,马凌波. 2016
[3]以色列红罗非鱼与其他罗非鱼群体杂交子一代在海水中生长性能分析. 张天时,姜涛,孔杰,魏宝振,筴金华,张艳红,栾生. 2015
[4]瓦氏雅罗鱼群体基于CO Ⅰ序列的遗传多样性分析. 窦新杰,常玉梅,唐然,孙效文,陶然,王楠,梁利群,张丽霞. 2014
[5]狼山鸡保种群不同世代线粒体COⅠ基因条形码变化规律研究. 屠云洁,束婧婷,章明,苏一军,单艳菊,姬改革,邹剑敏. 2016
[6]基于COⅠ基因的新入侵害虫番茄潜叶蛾遗传多样性分析. 马琳,李晓维,郭文超,王树明,王田珍,吕要斌. 2021
[7]银鲳3个野生群体线粒体COⅠ基因的序列差异分析. 彭士明,施兆鸿,侯俊利,张浩,赵峰. 2009
[8]魁蚶(Scapharca broughtonii)不同地理群体的遗传多样性及种群结构. 刘寒苗,吴彪,刘志鸿,杨爱国,周丽青,孙秀俊. 2017
[9]基于线粒体COⅠ序列比较长江口中华绒螯蟹放流与野生群体的遗传多样性. 彭欣悦,赵峰,张涛,耿智,朱美贵,庄平. 2016
[10]西江鲫的遗传多样性与群体结构. 匡天旭,帅方敏,陈蔚涛,李新辉. 2018
[11]基于线粒体COⅠ基因序列的棘头梅童鱼7个野生群体遗传结构分析. 赵明,宋炜,马春艳,张凤英,蒋科技,宋志明,马凌波. 2015
[12]三峡库区鲌属鱼类线粒体COⅠ基因遗传多样性的初步分析. 王丹,程庆武,杨镇宇,连玉喜,叶少文,刘家寿,李钟杰,罗相忠,邹桂伟. 2015
[13]2种东风螺线粒体基因序列多态性研究. 苏天凤,黄建华,吴进锋,江世贵. 2007
[14]狼山鸡保种群不同世代线粒体DNA条形码变化规律研究. 屠云洁,束婧婷,章明,苏一军,单艳菊,姬改革,邹剑敏. 2016
[15]3个地方鸡种线粒体DNA COⅠ基因条形码遗传多样性研究. 屠云洁,陈国宏,高玉时,王克华,童海兵,张学余. 2009
[16]基于线粒体COⅠ基因序列的三疣梭子蟹东海区群体遗传多样性分析. 王景,张凤英,蒋科技,马春艳,宋炜,林楠,姜亚洲,李圣法,程家骅. 2015
[17]基于线粒体COI基因的毛蚶群体遗传多样性. 田吉腾,侯丫,刘志鸿,杨爱国,吴彪,周丽青,董春光. 2016
[18]南海4个花刺参地理群体的遗传多样性研究. 文菁,范嗣刚,李海鹏,胡超群. 2018
[19]西双版纳黄瓜群体遗传多样性的SSR分析. 沈镝,方智远,戚春章,赵金艳,宋江萍,李全辉,李锡香. 2009
[20]基于CO I基因序列的东、黄海区野生与养殖大黄鱼遗传多样性分析. 谌微,张凤英,王景,魏鸿擎,姜亚洲,张辉,凌建忠,程家骅,马凌波. 2016
作者其他论文 更多>>
-
鳙体型差异个体转录组与miRNA的联合分析
作者:邓玉婕;朱文彬;傅建军;罗明坤;王兰梅;梁政远;董在杰
关键词:鳙;体型;骨骼发育;差异表达基因;差异表达miRNA
-
不同比例复合中草药添加剂对乾安肉羊生长性能、免疫及抗氧化能力的影响
作者:瞿子惠;韩振强;白煜;丁志新;朱文彬;赵静红
关键词:复方中草药添加剂;乾安肉羊;生长性能;免疫性能;抗氧化能力
-
"渔光互补"模式下美洲鲥养殖效益高
作者:董在杰;戴飞;全书翔;张渊;罗明坤;朱文彬
关键词:
-
美洲鲥最适麻醉剂的筛选及其应用
作者:董在杰;朱恩贤;罗明坤;冯冰冰;徐伟;戴飞
关键词:
-
福瑞鲤2号两种体色个体早期生长和形态差异及通径分析
作者:傅建军;朱文彬;罗明坤;龚雅婷;王兰梅;董在杰
关键词:鲤;体色;生长;形态差异;通径分析
-
高温对红白锦鲤胚胎及幼鱼生长、体色及热应激基因表达影响
作者:史秀兰;Chanutdharm Sotinbowonkrit;罗明坤;陈小玉;郭珺;林凯;朱文彬;傅建军;王兰梅;董在杰
关键词:红白锦鲤(Cyprinus carpio var.koi);温度;早期发育阶段;酶活;基因表达
-
温度对美洲鲥胚胎发育的影响
作者:梁政远;缪凌鸿;刘影;罗明坤;冯冰冰;朱文彬;龚雅婷;史秀兰;李玉林;蒋超;解旭东;董在杰
关键词:美洲鲥;温度;胚胎发育;基因表达;遗传育种
