桃(Prunus persica [L.] Batsch)转录组SSR信息分析及其分子标记开发

文献类型： 中文期刊

第一作者： 何平

作者： 何平;李林光;王海波;李慧峰;常源升

作者机构：

关键词： 桃;转录组;SSR;引物;多态性

期刊名称： 分子植物育种

ISSN： 1672-416X

年卷期： 2016 年 14 卷 11 期

页码： 3130-3135

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 利用MISA软件筛选桃(Prunus persica[L.]Batsch)转录组数据,获得的109 248条Unigene,检测出24 102个SSR位点,分布于22 689条Unigene中,出现频率为20.76%。SSRs位点中主导类型是以AG/CT(占总SSRs的18.70%)为主的二核苷酸重复,占总SSRs的33%;其次是三核苷酸重复,出现频率为27%;四核苷酸重复,占总SSRs的25%。利用Primer 5共设计出9 657对SSR引物。随机选择50对引物进行PCR扩增,其中20对扩增出清晰可重复的条带,并且在同属材料(苹果试材)中也能获得理想结果,引物多态性检测发现,在15份桃试材中,10对引物具有多态性,利用UPGMA作图,可将15个桃材料很好区分。结果表明,桃转录组测序产生的Unigene是开发SSR标记的有效信息,为SSR标记在桃的遗传分析上提供可靠的标记选择。

分类号： S662.1`Q943.2

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