用PCR-DGGE和16S rDNA测序解析吐温对绵羊瘤胃细菌多样性的影响

文献类型： 中文期刊

第一作者： 张慧玲

作者： 张慧玲;韩冰;贺三刚;刘泽兴;陈勇

作者机构：

关键词： 非离子表面活性剂;绵羊;瘤胃;细菌;聚合酶链式反应-变性梯度凝胶电泳

期刊名称： 新疆农业大学学报

ISSN： 1007-8614

年卷期： 2010 年 33 卷 06 期

页码： 469-474

收录情况： 北大核心

摘要： 选取装置永久性瘤胃瘘管的中国美利奴绵羊,采用5×5拉丁方试验设计,在绵羊日粮中分别添加5或10 g/d Tween 20,3或6 g/d Tween 80,以空白为对照,采用PCR-DGGE技术研究不同水平的非离子表面活性剂Tween 20和Tween 80对绵羊瘤胃中细菌多样性的影响;对DGGE指纹图谱中的12个优势DNA条带的16S rDNA进行测序和序列分析,在线寻找其相似的细菌分类。结果显示,5个组之间DGGE指纹图谱的相似性在65.4%～75.4%。与对照组相比,除10 g/d吐温20组外,其他各组的细菌丰度均有不同程度的下降。DNA序列分析表明,DGGE图谱中优势条带的16S rDNA序列中有8个条带序列与GenBank中已知序列的相似性大于97%。受吐温20影响的细菌与Microbacteriumoxydans、Schlegelella aquatica、Brevundi monas sp.、Lachnospir-aceae和Methylobacillus sp.有较高的相似性;而受吐温80影响的细菌与Schlegelella aquatica、Acinetobacter soli和Microbacteriumoxydans有较高的相似性。日粮中添加吐温20和吐温80后,高剂量的吐温20使绵羊瘤胃中的优势菌种类增加,吐温80和低剂量的吐温20使优势菌种类下降。在绵羊瘤胃细菌中,受吐温20和吐温80影响的种类不同。

分类号： S852.6

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