1株基因重组猪繁殖与呼吸综合征病毒的新型变异和遗传进化分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 胡栋

作者： 胡栋;朱迎春;赵情;庞恒;李传刚;王亭亭;常维山;彭军;吴家强

作者机构：

关键词： 猪繁殖与呼吸综合征病毒;变异毒株;遗传衍化;Nsp2基因;基因重组

期刊名称： 中国兽医学报

ISSN： 1005-4545

年卷期： 2021 年 41 卷 002 期

页码： 213-223

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 对山东省某地区初诊为猪繁殖与呼吸综合征(porcine reproduction and respiatory syndrome,PRRS)的猪病料采用RT-PCR进行鉴定,获得1株PRRSV并命名为SD18.对该分离株的第2代细胞培养毒株进行全基因组测序,与其他参考毒株比较同源性并构建遗传进化树.结果显示,SD18毒株属于美洲型高致病性PRRSV变异株,该毒株Nsp2基因具有31个不连续的氨基酸缺失,已明显区别于以JXA1、HUN4、TJ株等为代表的30个不连续缺失高致病性分离株,其中第830位氨基酸位点是最新发现的缺失氨基酸.同时,该毒株的ORF3基因第17位插入1个丝氨酸(S),而ORF5基因编码的第13位和第151位氨基酸均为具有强毒特性的精氨酸(R),第137位则插入了具有野毒特性的丝氨酸(S),这4个氨基酸位点也表现出不同于以往高致病性毒株变异的特征.采用基因重组分析软件RDP4分析表明,该新型缺失株的多个部位发生了基因重组;SD18毒株病毒以美洲经典毒株VR2332作为重组的主要亲本毒株,疫苗株JXA1-R和新型毒株NADC30-like提供重组片段,多数重组变化集中在Nsp2蛋白区域,在非结构蛋白和次要蛋白区域也可见部分重组变化.本研究为深入探索PRRSV的遗传变异规律及相关生物学特性研究积累了数据.综合分析表明,山东地区SD18分离株Nsp2、GP3、GP5相应氨基酸均出现了较大变异,特别是Nsp2出现一个新的氨基酸缺失,可能是该毒株形成了一个新的独立变异分支的重要原因;这些变异也提示该分离毒株在病毒编码蛋白及其免疫原性等方面出现了较大变化.该病毒株的成功分离鉴定与遗传进化分析为PRRSV衍化及流行病学调查积累了最新数据,也为预防控制该病提供参考.

分类号： S852.65

  • 相关文献

[1]山东及周边部分地区猪繁殖与呼吸综合征病毒的变异与遗传演化分析. 胡栋,徐煜琳,朱迎春,赵情,王亭亭,庞恒,李传刚,于江,常维山,吴家强,彭军. 2019

[2]高致病性猪繁殖与呼吸综合征病毒HBR株的培育及动物感染试验. 危艳武,刘长明,范培虎,吴洪丽,温士刚,陆月华. 2010

[3]用荧光定量RT-PCR法对高致病性PRRSV变异株感染猪体内分布规律的研究. 危艳武,刘长明,张朝霞,黄立平. 2009

[4]高致病性猪繁殖与呼吸综合征病毒HBR变异株第125代的毒力试验. 危艳武,刘长明,范培虎,吴洪丽,温士刚. 2011

[5]荧光定量RT-PCR法对高致病性PRRSV变异株感染猪体内分布规律的研究. 危艳武,刘长明,张朝霞,黄立平. 2010

[6]猪繁殖与呼吸综合征病毒贵州PT分离株Nsp2基因克隆及序列变异分析. 周思旋,徐健,吴屿彤,史开志,徐洪忠,肖芳萍. 2014

[7]猪繁殖与呼吸综合征病毒WF-1株的分离鉴定及NSP2和ORF5基因的变异分析. 李坤,吴家强,张金强,李俊,于江,刘洋,张玉玉,刘少宁,王兆,周顺,王金宝. 2010

[8]猪繁殖与呼吸综合征病毒主要流行毒株检测方法的建立. 郭振华,陈鑫鑫,郭军庆,乔松林. 2017

[9]猪繁殖与呼吸障碍综合征病毒Nsp2基因缺失株Jiangxi-3灭活疫苗免疫效果评价. 王旭荣,张彩勤,赵炳武,宋长绪. 2010

[10]PRRSV SX-1株的分离与NSP2和ORF5基因的克隆及变异分析. 张金强,吴家强,朱向福,于美芳,白华,孟斌,任素芳,王文志,王金宝. 2009

[11]猪繁殖与呼吸综合征病毒JX0708株的分离鉴定及其Nsp2基因的遗传变异分析. 贾怀杰,陈国华,房永祥,王晓霞,李小庆,莫斯科,瞿惠玲,景志忠. 2010

[12]2013年-2014年江西地区PRRSV分离株NSP2及ORF5基因的遗传变异分析. 李海琴,林娟,刘垒,季华员. 2015

[13]中国部分地区2005-2007年猪繁殖与呼吸综合征病毒分离株ORF5基因和Nsp2基因遗传变异分析. 薛青红,张彦明,刘湘涛,郎洪武,邹敏,高金源,邓永. 2009

[14]PRRSV山西株ORF5和Nsp2基因序列分析. 姚敬明,刘文俊,罗甜甜,吴忻,王娟萍,孟帆,韩一超,樊振华,米瑞娟. 2014

[15]我国苏皖地区PRRSV Nsp2和ORF5基因的遗传变异分析. 李彬,何孔旺,温立斌,俞正玉,茅爱华,王小敏,张雪寒,郭容利,倪艳秀,周俊明,吕立新. 2011

[16]PRRSV分离株Nsp2基因和ORF5基因的遗传变异分析. 王剑非,孙建全,张金强,迟小伟,刘杰,丛晓燕,时建立,李俊,吴家强. 2011

[17]猪繁殖与呼吸综合征病毒TJM株Nsp2基因缺失片段的原核表达及免疫活性分析. 黄双,王凤雪,温永俊,高维凡. 2014

[18]1株类NADC30与类JXA1重组的猪繁殖与呼吸综合征病毒基因组遗传特征分析. 郭振华,阮海宇,耿瑞,陈鑫鑫,乔松林,邓瑞广,张改平. 2020

[19]中国猪伪狂犬病的流行及防控. 郭镇洋,田志军,彭金美. 2023

[20]宿主蛋白CypA抑制传染性法氏囊病病毒增殖. 王念,张礼洲,陈玉明,高立,卢珍,高玉龙,王永强,高宏雷,刘长军,崔红玉,李凯,王笑梅,祁小乐. 2014

作者其他论文 更多>>

微信小程序