辣椒GRAS家族全基因组鉴定与表达分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 张焕欣

作者： 张焕欣;董春娟;尚庆茂

作者机构：

关键词： 辣椒;GRAS基因家族;进化分析;表达特性

期刊名称： 园艺学报

ISSN： 0513-353X

年卷期： 2017 年 12 期

页码： 2305-2317

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 基于辣椒全基因组数据信息,利用生物信息学方法对CaGRAS基因家族进行了系统鉴定和进化分析,并通过Real-time PCR方法检测了CaGRAS家族组织表达模式和对PEG6000、盐胁迫的应答。结果表明:在辣椒中存在54个CaGRAS基因,除11号染色体外其余染色体均有分布,外显子数1~3,等电点4.97~9.13;系统进化分析显示CaGRAS基因可分为8个进化群;CaGRAS基因具有不同的表达模式,在根、茎、叶片和茎尖中优势表达的基因分别有34、8、3和8个;多数CaGRAS基因能响应PEG6000和盐胁迫,其中CaGRAS11、CaGRAS30、CaGRAS40、CaGRAS44和CaGRAS50受到PEG6000和盐胁迫的强烈诱导。本研究为深入解析CaGRAS家族基因的功能奠定了一定基础。

分类号： S641.3

  • 相关文献

[1]甜瓜Dof家族全基因组鉴定与表达分析. 张焕欣,李国权,杨惠栋,曹娜,朱方红. 2019

[2]辣椒全基因组中LBD转录因子的鉴定与表达分析. 张亚利,胡灿,戴雄泽,刘峰,袁祖华. 2016

[3]辣椒bZIP家族基因的鉴定与表达分析. 魏瑞敏,郑井元,刘峰,马艳青,李雪峰,杨博智,邹学校,谢玲玲,戴雄泽. 2018

[4]中华猕猴桃GRAS基因家族鉴定及低温胁迫表达分析. 毛可欣,王海荣,安淼,刘腾飞,王世金,李健,李国田. 2023

[5]巴西橡胶树GRAS基因家族鉴定及表达分析. 李娟,袁渊,吴挺开,邓治,程汉. 2024

[6]猪脂肪甘油酸脂酶(ATGL)基因的表达特性分析. 杨红文,粟朝芝,王德凤. 2012

[7]地衣芽胞杆菌碱性蛋白酶基因克隆与表达特性. 许发芝,李吕木,徐子伟,张志才. 2011

[8]甘蓝型油菜GPDH基因克隆、表达分析及植物过表达载体构建. 张超,付三雄,周小婴,唐容,黄莎,杨克相,戚存扣. 2019

[9]甜菜夜蛾SeKr-h1基因分子表达特性及其对保幼激素类似物的响应. 赵静,谭永安,房菊,朱友雯,姜义平,肖留斌. 2021

[10]普通小麦祖先种类TaNAC2a基因的鉴定分析和表达模式研究. 张凤洁,李雪垠,高世庆,冯变娥,刘婷婷,唐益苗,赵昌平,王爱萍. 2014

[11]瓦氏雅罗鱼SLC26A1基因的克隆及表达特性分析. 孙博,常玉梅,张立民,梁利群. 2020

[12]尖孢镰刀菌古巴专化型4号生理小种的磷酸化应激诱导蛋白1(FoSTIP1)基因的克隆及表达分析. 齐兴柱,汪军,刘磊. 2019

[13]甘薯查尔酮异构酶基因IbCHI的克隆和表达特性. 饶莉萍,苏文瑾,刘意,宋天晓,SOVIGUIDI Deka Reine Judess,张文英,杨新笋. 2020

[14]昆虫普通气味结合蛋白研究进展. 张雪,黄聪,武强,杨念婉,钱万强,万方浩. 2021

[15]桃PpPGIP1启动子的分离与功能分析. 王秀云,张计育,古成彬,高志红,章镇,俞明亮,张好艳. 2012

[16]大豆中介体亚基基因鉴定及表达特性分析. 魏荷,李海朝,练云,雷晨芳,武永康,李金英,王丰青. 2016

[17]蜻蜓凤梨AfDREB2C基因的克隆及乙烯响应特性分析. 雷明,王加宾,丛汉卿,李志英,徐立. 2016

[18]圆斑星鲽促性腺激素释放激素基因克隆及表达特性. 柳学周,徐永江,廖梅杰,潘传燕,王妍妍. 2013

[19]茶树鸟苷酸交换因子CsRopGEF1和CsRopGEF3基因的克隆及表达特性. 赵悦,申加枝,马媛春,文博,周琳,朱旭君,王玉花,房婉萍. 2018

[20]甘蔗各家族SPS基因表达特性分析. 汪淼,秦翠鲜,陈忠良,廖青,李杨瑞,黄东亮. 2016

作者其他论文 更多>>

微信小程序