华支睾吸虫细胞外囊泡中miRNAs调控宿主靶基因的预测及生物信息学分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 魏伟

作者： 魏伟;孙云异;毛瑞锋;张爱辉;贾斌;张军;王春仁;高俊峰

作者机构：

关键词： 华支睾吸虫;miRNAs;细胞外膜囊泡;靶基因;生物信息学

期刊名称： 黑龙江畜牧兽医

ISSN： 1004-7034

年卷期： 2023 年 17 期

页码： 1-6+12+139

收录情况： 北大核心

摘要： 为了评估华支睾吸虫(Clonorchis sinensis)细胞外膜囊泡中虫源miRNAs跨物种调控宿主基因的风险，试验利用miRBase数据库对华支睾吸虫细胞外膜囊泡和感染阳性宿主细胞共有的虫源miRNAs成熟体序列进行筛选，通过miRanda软件对细胞外膜囊泡中表达量排在前10位的miRNAs进行靶基因预测，选取每个miRNAs评分排在前10位的靶基因作为候选靶基因，通过NCBI、Bing检索工具检索miRNAs候选靶基因的功能，利用GO功能注释及KEGG富集分析对靶基因进行生物信息学分析。结果表明：华支睾吸虫细胞外膜囊泡中的10种miRNAs共对应8 128个与宿主相关的靶基因。有12个候选靶基因没有相关的功能报道，12个候选靶基因与肝功能有关，其余候选靶基因在癌症、信号转导、结构骨架、增殖和分化、迁移功能中发挥重要作用。候选靶基因Taf10和Onecut2与肝脏和肝胆管发育相关，候选靶基因Gng1和Hhip分别可参与致纤维化相关的丝裂原活化蛋白激酶(mitogen-activated protein kinase, MAPK)和Hedgehog信号通路。说明虫源miRNAs有靶向宿主细胞并参与致宿主肝纤维化和肝癌的风险。

分类号： S852.735

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