鲟形目鱼类rDNA扩增及限制性位点分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 汪登强

作者： 汪登强;危起伟;罗晓松;方耀林

作者机构：

关键词： 鲟形目;rDNA;PCR;限制性位点

期刊名称： 中国水产科学

ISSN： 1005-8737

年卷期： 2006 年 13 卷 06 期

页码： 885-890

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 使用长PCR技术扩增鲟形目(Acipenseriformes)15个种的核糖体DNA(rDNA)18S rRNA基因与28S rRNA基因之间约2.5 kb的片段,并用7个限制性内切酶对该片段进行限制性位点分析。结果显示,使用LATaqDNA聚合酶及GCBuffer结合长PCR技术能够很好地扩增鲟形目鱼类的rDNA。根据酶切图谱可确定93个限制性位点,其中21个为保守位点,72个多态信息位点。HhaⅠ酶切的带型在所有个体中完全一致,提示这些位点对保持rDNA的功能有重要作用。一些酶的酶切产物长度之和大于扩增产物的长度,暗示鲟形目鱼类个体内存在多个rDNA等位基因。对种间遗传距离进行计算,并构建UPGMA分子系统树,发现鲟科鱼类的系统关系与以往研究有较大差别,这可能是受个体内rDNA等位基因存在的影响,说明用酶切片段来重建鲟科鱼类的系统树不太可靠。文中还讨论了高GC含量模板的PCR扩增和rDNA在鲟形目分子系统关系中的使用。

分类号： Q953

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