利用全基因组关联分析获得白菜A01染色体定位的霜霉病抗病位点和相关分子标记开发

文献类型： 中文期刊

第一作者： 只升华

作者： 只升华;苏同兵;于拴仓;张凤兰;余阳俊

作者机构：

关键词： 大白菜;霜霉病;全基因组关联分析;简化基因组测序;竞争性等位基因特异性PCR

期刊名称： 植物生理学报

ISSN： 2095-1108

年卷期： 2016 年 52 卷 05 期

页码： 693-702

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 本研究对202份大白菜自然群体材料进行简化基因组测序(Specific Locus Amplified Fragment Sequencing,SLAF),并通过测序深度、SLAF标签的多态性与参考基因组的相似程度等指标的筛选,获得了全基因组均匀分布的960个SLAF分子标记。结合相应材料的霜霉病病情调查结果,利用所述960个SLAF标记进行全基因组关联分析。结果显示:(1)在A01染色体上检测到1个新的与抗霜霉病关联的SLAF标记,即SLAFMarker A0124655323;(2)根据SLAFMarker A0124655323左右两翼最近标记之间的距离确定此热点区间为A01染色体24573724~24755150的物理范围;(3)利用该区间内的一个SNP开发出适用于KASP分型技术的SNP分子标记,在各亚群选择准确率均在80%以上;(4)在此区间找到抗病相关基因13个。本研究获得的新的抗病位点和开发的SNP分子标记,将有助于大白菜抗霜霉病分子育种。

分类号： S436.341.12

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