基于荧光标记的紫娟茶树转录组EST-SSR标记开发

文献类型： 中文期刊

第一作者： 陈春林

作者： 陈春林;田易萍;陈林波;邓少春;徐丕忠;李朝云

作者机构：

关键词： 茶树;转录组;SSR;荧光标记

期刊名称： 江苏农业学报

ISSN： 1000-4440

年卷期： 2018 年 04 期

页码： 747-753

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为开发紫娟茶树转录组EST-SSR标记,基于前期对紫娟茶树芽、第2叶、开面叶、成熟叶转录组高通量测序所得到的242 757条Unigene进行多态性分析与评价,再利用荧光标记PCR技术,规模化开发茶树EST-SSR标记。结果表明:从紫娟茶树转录组中搜索得到46 041条Unigene含有57 976个SSR位点,出现频率为23.88%。EST-SSR类型以一核苷酸、二核苷酸、三核苷酸重复为主,占总SSR的98.54%。设计合成138对荧光SSR引物,采用荧光标记PCR技术对4个差异较大的茶树品种进行引物筛选,其中44对引物得到高质量的EST-SSR标记位点。这些EST-SSR可用于茶树遗传多样性分析、分子育种等。

分类号： S571.1

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