从大豆疫霉菌ESTs中发掘SSR标记

文献类型： 中文期刊

第一作者： 朱振东

作者： 朱振东;霍云龙;王晓鸣;黄俊斌;武小菲

作者机构：

关键词： 表达序列标签;SSR标记;大豆疫霉菌;大豆

期刊名称： 科学通报

ISSN： 0023-074X

年卷期： 2004 年 49 卷 17 期

页码： 1749-1754

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 通过对5800条大豆疫霉菌EST进行电子查询, 在369条EST中发现415个SSR. 在筛选的EST序列中SSR平均密度为每 8.9 kb含有1个SSR. 在鉴定的SSR中, 三核苷酸重复基元的SSR类型最多, 占鉴定总数的50.1%, 四核苷酸重复基元的SSR类型最少, 为8.2%. 设计40个SSR引物对对5个大豆疫霉菌菌株基因组DNA进行PCR扩增, 有33个引物对扩增出SSR特征条带, 其中有28个引物对扩增出在预期片段大小范围之内的条带. 在33个功能性引物对中, 有15个引物对在5个大豆疫霉菌菌株间扩增出多态性, 多态性引物对占45.5%. 基于SSR标记进行聚类分析, 可将5个检测大豆疫霉菌菌株划分为不同的3个组. 本研究建立了大豆疫霉菌的SSR标记, 为大豆疫霉菌及相关属种的鉴定、遗传变异、分子作图等研究提供了一种更加有效的分子标记系统.

分类号： S435.65

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