基于cDNA-SCoT差异显示的甘蔗应答水分胁迫基因表达谱分析（英文）

文献类型： 中文期刊

第一作者： 吴凯朝

作者： 黄诚梅;邓智年;魏源文;曹辉庆;徐林;蒋胜理;吴建明;杨丽涛;李杨瑞

作者机构：

关键词： 甘蔗;cDNA-SCoT;水分胁迫;复水;基因表达谱

期刊名称： 南方农业学报

ISSN： 2095-1191

年卷期： 2016 年 47 卷 12 期

页码： 1999-2008

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 【目的】研究甘蔗应答水分胁迫差异基因表达,进一步探究甘蔗应答水分胁迫的分子机制,为开展甘蔗抗旱综合性遗传改良研究提供科学依据。【方法】选用GT11为材料,分别构建对照、干旱、复水3个处理总RNA混合池,使用cDNA-SCoT差异显示构建GT11伸长期应答水分胁迫的基因表达谱,筛选、分离TDFs进行测序,在NCBI数据库进行BLAST同源性检索,根据同源基因推测基因功能。【结果】通过42条SCoT引物筛选得到180个TDFs,有100个TDFs与NCBI数据库中已录入的基因具有较高的相似性,根据同源基因功能可分为14类:新陈代谢相关基因(11个)、能量代谢相关基因(12个)、运输途径相关基因(5个)、通信及信号转导相关基因(6个)、细胞循环及DNA加工相关基因(3个)、转录调控因子相关基因(3个)、蛋白质合成相关基因(17个)、蛋白质加工相关基因(1个)、结合功能蛋白相关基因(7个)、环境互作相关基因(3个)、转座子、毒性及质粒蛋白相关基因(5个)、细胞成分生物合成相关基因(1个)、防御相关基因(4个)和未知功能蛋白基因(22个)。【结论】甘蔗应答水分胁迫调节途径具有多样性、复杂性、协调性和网络性;应用cDNA-SCoT差异显示筛选获得水分胁迫相关TDFs,可为进一步研究甘蔗应答水分调控途径的分子机理提供重要信息。

分类号： S566.1

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