大口黑鲈溃疡综合征病毒甲基转移酶基因序列分析与原核表达
文献类型: 中文期刊
第一作者: 马冬梅
作者: 马冬梅;白俊杰;邓国成;李胜杰
作者机构:
关键词: 大口黑鲈(Micropterus salmoides);大口黑鲈溃疡综合征病毒(LBUSV);DNA甲基转移酶;原核表达
期刊名称: 农业生物技术学报
ISSN: 1674-7968
年卷期: 2011 年 19 卷 02 期
页码: 342-349
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: 为了对新分离到的大口黑鲈溃疡综合征病毒(Largemouth bass ulcerative syndrome virus,LBUSV)的特征作进一步了解,促进LBUSV、DFV(Doctor fish virus)和LMBV(Largemouth bass virus)这类病毒的深入研究,本文克隆了LBUSV DNA甲基转移酶(DNA MTase)基因约200bp的保守核心片段,用基因组步移的方法扩增到了核心片段的侧翼序列,获得了DNAMTase基因的编码区全长序列。序列分析表明,DNA MTase基因开放阅读框共663bp(GenBank登录号:GU256634),编码220个氨基酸。结构域分析显示,LBUSV DNA MTase蛋白具有4个保守的DNAMTase结构域Ⅰ、Ⅳ、Ⅵ和Ⅷ,以及辅酶结合位点、底物结合位点和DNA结合位点等DNA MTase活性位点,其中的脯氨酸-脯氨酸-半胱氨酸三肽是潜在的催化位点。另外,本文还根据DNA MTase基因开放阅读框设计引物,PCR扩增和酶切后插入到pBV220载体中,经转化大肠杆菌(Escherichia coli)DH5α,温度诱导和SDS-PAGE检测,重组菌在分子量25kD处有一条特异蛋白带,重组蛋白约占菌体总蛋白的30%。研究结果推测,该基因编码的蛋白具有DNA甲基化的功能,该病毒的分类地位为虹彩病毒科蛙病毒属。
分类号: S943
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