黄瓜花叶病毒(CMV)2个山西分离物CP序列测定及亚组分类分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 张璇

作者： 赵慧琪;王德富;郭尚;刘勇;牛颜冰

作者机构：

关键词： 番茄;黄瓜花叶病毒;序列分析;亚组分类分析

期刊名称： 植物病理学报

ISSN： 0412-0914

年卷期： 2018 年 01 期

页码： 35-45

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 在生物学检测的基础上,利用酶联免疫检测、非序列依赖性PCR(sequence-independent amp-lification,SIA)对感病番茄进行分子鉴定,表现卷叶和花叶症状的番茄均被黄瓜花叶病毒(Cucumber mosaic virus,CMV)侵染,分离物分别命名为SXFQ(GenBank登录号为JX993914)和FQ(GenBank登录号为JX993912)。为明确其分类地位,对二者外壳蛋白(coat protein,CP)进行克隆和测序分析。应用DNAMAN软件对本课题组前期检测的7个CMV山西分离物、SXFQ、FQ以及其他3个CMV典型分离物CP序列进行比较分析,发现核苷酸和氨基酸序列最大相似性分别为77.1%~100%和81.6%~100%。氨基酸序列系统进化分析表明,9个CMV山西分离物属于CMV亚组I B的2个分支,其中在指示植物上表现较强症状的SXFQ与其他5个分离物为一分支,在指示植物上表现较弱症状的FQ与其他2个分离物为另一分支。对9个山西分离物CP进行亚组分类分析,结果表明其理化性质、稳定性、疏水性与预测结果相近,2个分支的分离物分别出现相近的氨基酸变异和蛋白结构,存在一定规律性。

分类号： S432.41

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