西藏光核桃SRAP-PCR反应体系的优化和引物筛选

文献类型： 中文期刊

第一作者： 谭江平

作者： 谭江平;曾秀丽;廖明安;邱利娜;王玉霞;次仁卓嘎

作者机构：

关键词： 光核桃;SRAP;正交设计;体系优化;引物筛选

期刊名称： 北方园艺

ISSN： 1001-0009

年卷期： 2011 年 02 期

页码： 139-143

收录情况： 北大核心

摘要： 以西藏12份光核桃种质为试材,采用正交设计,从dNTPs、Mg~(2+)、引物、模板DNA和Taq DNA聚合酶5种因素5个水平来优化SRAP-PCR反应体系,并对引物进行了筛选。结果表明:光核桃25μL的SRAP反应体系的最佳组分包括2.5μL 10×buffer,0.35 mmol/L dNTPs,1.5 mmol/L Mg~(2+),0.4μmol/L引物,20 ng模板DNA和2.5 U Taq DNA聚合酶。各因素对扩增反应结果均有不同影响,其中以dNTPs浓度影响最大,模板DNA的影响最小。应用该体系从40个引物组合中共筛选出扩增条带清晰、多态性丰富的SRAP引物组合23个。这一体系的建立及多态性引物组合的筛选为利用SRAP标记技术进行光核桃遗传多样性研究提供了依据。

分类号： S664.1

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