中国部分地区2005-2007年猪繁殖与呼吸综合征病毒分离株ORF5基因和Nsp2基因遗传变异分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 薛青红

作者： 薛青红;张彦明;刘湘涛;郎洪武;邹敏;高金源;邓永

作者机构：

关键词： 猪繁殖与呼吸综合征病毒;病毒分离;ORF5基因;Nsp2基因;遗传变异

期刊名称： 中国农业科学

ISSN： 0578-1752

年卷期： 2009 年 42 卷 05 期

页码： 1805-1812

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 【目的】为分析2005-2007年间中国部分省区猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)流行毒株的分子生物学特征,了解其遗传演化规律,查明中国目前PRRSV流行毒株现状。【方法】应用病毒分离方法从中国4个省份在2005-2007年间采集的81份疑似蓝耳病病料中分离到36株猪繁殖与呼吸综合征病毒,应用RT-PCR方法对36株PRRSV现地分离株的ORF5基因和Nsp2基因进行扩增和序列分析。【结果】36株现地分离株均属于美洲型PRRSV,ORF5基因全长均为603bp,未发现有基因缺失或插入,编码约200个氨基酸,分离株推导氨基酸序列变异主要发生在9～39位;36个分离株中有15株PRRSVNsp2基因全长为2940bp,21株PRRSVNsp2基因全长为2850bp;发生Nsp2缺失的PRRSV在Nsp2基因第481位、532～560位发生了不连续缺失,共缺失30个氨基酸。与GeneBank中收录的14个PRRSVORF5、Nsp2基因进行核苷酸及氨基酸序列比较和分析,系统进化关系显示,除B02-2005株可能与疫苗株有关外,多数现地分离株与Ch-1a株遗传距离较近,不同年份分离到的毒株与早期PRRSV分离株的同源性逐年降低。【结论】根据氨基酸变异情况对PRRSV现地分离株进行亚群聚类分析,发现36株现地分离株分别归属于以VR-2332为代表的4亚群,以BJ-4为代表的1亚群和以Ch-1a为代表的2亚群。进化关系表明PRRSVORF5、Nsp2基因及其推导的氨基酸序列均发生了较大变异,不同地区PRRSV分离株的遗传关系存在交叉现象,地域特征不明显。

分类号： S852.65

  • 相关文献

[1]我国苏皖地区PRRSV Nsp2和ORF5基因的遗传变异分析. 李彬,何孔旺,温立斌,俞正玉,茅爱华,王小敏,张雪寒,郭容利,倪艳秀,周俊明,吕立新. 2011

[2]猪繁殖与呼吸综合征病毒WF-1株的分离鉴定及NSP2和ORF5基因的变异分析. 李坤,吴家强,张金强,李俊,于江,刘洋,张玉玉,刘少宁,王兆,周顺,王金宝. 2010

[3]猪繁殖与呼吸综合征病毒主要流行毒株检测方法的建立. 郭振华,陈鑫鑫,郭军庆,乔松林. 2017

[4]PRRSV SX-1株的分离与NSP2和ORF5基因的克隆及变异分析. 张金强,吴家强,朱向福,于美芳,白华,孟斌,任素芳,王文志,王金宝. 2009

[5]2013年-2014年江西地区PRRSV分离株NSP2及ORF5基因的遗传变异分析. 李海琴,林娟,刘垒,季华员. 2015

[6]PRRSV山西株ORF5和Nsp2基因序列分析. 姚敬明,刘文俊,罗甜甜,吴忻,王娟萍,孟帆,韩一超,樊振华,米瑞娟. 2014

[7]PRRSV分离株Nsp2基因和ORF5基因的遗传变异分析. 王剑非,孙建全,张金强,迟小伟,刘杰,丛晓燕,时建立,李俊,吴家强. 2011

[8]变异型PRRSV-FJ09A毒株ORF5和NSP2基因的遗传变异分析及致病性. 王隆柏,张志灯,车勇良,吴学敏,陈如敬,邵良平,庄向生,周伦江. 2012

[9]猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)江苏分离株NJGC ORF5基因的克隆及遗传变异分析. 李彬,毛立,何孔旺,刘彦玲,温立斌,俞正玉,茅爱华,王小敏,张雪寒,郭容利,周俊明,倪艳秀,吕立新. 2011

[10]山东地区猪繁殖与呼吸综合征病毒分子特征. 战翔,李娟,张熙艳,刘洋,李俊. 2011

[11]新疆猪繁殖与呼吸综合征病毒分离鉴定及其Nsp2和ORF5基因遗传变异分析. 张美玲,陆桂丽,薛晶,刘丽雅,简子健,夏俊. 2014

[12]猪生殖与呼吸综合征病毒NX/ZhW/07株的分离鉴定及其ORF5、Nsp2基因特性分析. 满自萍,田宏,吴锦艳,赵娜,尚佑军. 2009

[13]猪繁殖与呼吸综合征病毒贵州PT分离株Nsp2基因克隆及序列变异分析. 周思旋,徐健,吴屿彤,史开志,徐洪忠,肖芳萍. 2014

[14]山东及周边部分地区猪繁殖与呼吸综合征病毒的变异与遗传演化分析. 胡栋,徐煜琳,朱迎春,赵情,王亭亭,庞恒,李传刚,于江,常维山,吴家强,彭军. 2019

[15]1株基因重组猪繁殖与呼吸综合征病毒的新型变异和遗传进化分析. 胡栋,朱迎春,赵情,庞恒,李传刚,王亭亭,常维山,彭军,吴家强. 2021

[16]猪繁殖与呼吸障碍综合征病毒Nsp2基因缺失株Jiangxi-3灭活疫苗免疫效果评价. 王旭荣,张彩勤,赵炳武,宋长绪. 2010

[17]猪繁殖与呼吸综合征病毒JX0708株的分离鉴定及其Nsp2基因的遗传变异分析. 贾怀杰,陈国华,房永祥,王晓霞,李小庆,莫斯科,瞿惠玲,景志忠. 2010

[18]猪繁殖与呼吸综合征病毒TJM株Nsp2基因缺失片段的原核表达及免疫活性分析. 黄双,王凤雪,温永俊,高维凡. 2014

[19]含CpG序列PRRSV ORF5基因真核表达质粒在小鼠的细胞免疫应答. 温建新,李俊,周顺,任慧英,刘文华,邹玲,徐文,牛钟相,王金宝. 2009

[20]含CpG序列PRRSV ORF5基因真核质粒对猪体免疫作用研究. 温建新,王金宝. 2008

作者其他论文 更多>>

微信小程序