云南大花蕙兰复合感染的ORSV和CyCMV病毒基因组序列特征分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 金晓香

作者： 金晓香;姚俊汐;尹跃艳;李婷婷;郭淼;钟静;和寿星;陈越;和家卫;鄢波;丁铭

作者机构：

关键词： 大花蕙兰;齿兰环斑病毒;建兰褪绿花叶病毒;基因组序列特征;复合侵染

期刊名称： 园艺学报

ISSN： 0513-353X

年卷期： 2024 年 008 期

页码： 1844-1852

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 从云南丽江采集了40个大花蕙兰（Cymbidium hybridum）感病样品，利用高通量转录组测序对其中的病毒种类进行分析，Blastn N比对发现样品中存在建兰花叶病毒（cymbidium mosaic virus,Cym MV）、齿兰环斑病毒（odontoglossum ringspot virus,ORSV）和建兰褪绿花叶病毒（cymbidium chlorotic mosaic virus,Cy CMV）。利用RT-PCR对样品中病毒分离物的CP序列进行扩增，10份样品为ORSV和Cy CMV复合侵染。为进一步明确ORSV和Cy CMV云南分离物（ORSV-DH和Cy CMV-DH）的序列特征，分别对其全基因组序列进行了扩增及克隆，结果表明：ORSV-DH基因组全长序列为6 611 nt(Accession No.OP644547),Cy CMV-DH基因组全长序列为4 083 nt(Accession NO.OP629812），将ORSV-DH和Cy CMV-DH分别与已报道的分离物的全基因组序列进行核苷酸序列分析，发现ORSV-DH与其他分离物的核苷酸相似性为97.69%～99.41%,Cy CMV-DH为89.84%～98.19%。根据病毒全基因组核苷酸序列分别构建了ORSV-DH和Cy CMV-DH与本属其他分离物的系统进化树，明确了其分别与日本分离物ORSV-Cy-1(S83257）、Cy CMV-Japan(NC＿027123）亲缘关系最近。

分类号： S436.8

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