利用重测序–BSA分析鉴定金柑油胞发育相关基因

文献类型： 中文期刊

第一作者： 刘梦雨

作者： 刘梦雨;刘小丰;江东;朱世平;申晚霞;余歆;薛杨;赵晓春

作者机构：

关键词： 金柑;油胞发育;重测序–BSA分析;同源分析;功能注释

期刊名称： 园艺学报

ISSN： 0513-353X

年卷期： 2019 年 005 期

页码：

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为了鉴定与金柑油胞发育相关的基因,用多油胞的罗纹金柑[Fortunella japonica(Thunb.)Swingle,母本]和少油胞的滑皮金柑(Fortunella crassifolia Swingle 'Huapi',父本)进行杂交构建了F1代分离群体,从159个F1代单株中挑选出高油胞密度和低油胞密度的单株各30株,分别构建两个极端性状的DNA混池用于基因组重测序.利用重测序数据结合混合分组分析法(Bulked Segregant Analysis,BSA)进行遗传关联性分析,将控制油胞数量性状的位点定位在第9条染色体的25 980 001~29 160 001 bp的区域内.该区域包含511个有效的SNP,分布在301个基因位点上.同源性功能分析后获得11个与细胞程序性死亡、细胞壁功能和结构及细胞伸长和膨大等生理过程相关的候选基因(Ciclev10005243m.g、Ciclev10005288m.g、Ciclev10005338m.g、Ciclev10005441m.g、Ciclev10006448m.g、Ciclev10005804m.g、Ciclev10004719m.g、Ciclev10005888m.g、Ciclev10006502m.g、Ciclev10005197m.g和Ciclev10004431m.g),这些基因可能在柑橘油胞的发育过程中起重要作用.

分类号： S666

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