棘头梅童鱼肝型脂肪酸结合蛋白基因克隆及组织表达分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 欧阳文杰

作者： 欧阳文杰;宋炜;陈佳;桂福坤;程家骅;谢正丽;冯广朋

作者机构：

关键词： 棘头梅童鱼;肝型脂肪酸结合蛋白;基因克隆;组织表达

期刊名称： 水产科技情报

ISSN： 1001-1994

年卷期： 2022 年 49 卷 006 期

页码： 317-324

收录情况： 北大核心

摘要： 为进一步了解肝型脂肪酸结合蛋白基因(L-FABP基因)在棘头梅童鱼(Collichthys lucidus)营养调控、脂肪酸代谢和免疫应答等方面的功能作用,以棘头梅童鱼全基因组组装数据为基础,获得L-FABP基因的含开放阅读框的cDNA序列,利用生物信息学方法分析编码的蛋白质结构及进化关系,采用荧光定量(qRT-PCR)技术研究了不同组织中L-FABP基因的表达情况.结果表明,L-FABP基因cDNA序列为475 bp,其中5'非翻译区为51 bp,3'非翻译区为40 bp,开放阅读框为384 bp,编码127个氨基酸.其结构由10个β-折叠链和2个α-螺旋链组成,在氨基酸3~126位点间具有保守的脂质/胞质性脂肪酸结合结构域.棘头梅童鱼L-FABP基因与大黄鱼、条纹狼鲈同源性较近,与绿河鲀、尼罗罗非鱼和斑马鱼同源性较远.L-FABP基因在棘头梅童鱼肝脏、肠道、眼、大脑、心脏、肌肉、胃、鳃、脾脏、头肾和中肾中均有表达,其中肝脏中的L-FABP相对表达量最高,显著高于其他组织(P<0.05).

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