甘蓝型油菜BnEOD3基因克隆与比较测序分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 俎峰

作者： 俎峰;李霞;何晓莹;张国建;张建昆;董云松;王敬乔;束正齐;陈苇

作者机构：

关键词： 油菜;基因克隆;大籽粒;比较测序;EOD3基因

期刊名称： 西南农业学报

ISSN： 1001-4829

年卷期： 2019 年 01 期

页码： 20-24

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 【目的】克隆拟南芥籽粒大小发育母体效应基因EOD3在甘蓝型油菜籽粒中表达的同源基因拷贝,并在大、小籽粒材料间开展序列比较分析。【方法】以1份大籽粒与1份小籽粒种质发育中的籽粒为研究材料,利用RT-PCR克隆发育中籽粒表达的BnEOD3基因拷贝,结合生物信息学手段在大、小籽粒材料间进行差异比较分析。【结果】生物信息学分析发现BnEOD3基因在甘蓝型油菜中有4个同源拷贝(BnaC04g00760D,BnaA05g01200D,BnaC04g50960D,BnaA04g27100D)。其中BnaA04g27100D在大、小籽粒材料发育籽粒中均有表达,且在第114碱基处存在SNP变异(大籽粒为C,小籽粒为G),BnaC04g50960D则仅在小籽粒材料中检测到表达,BnaC04g00760D与BnaA05g01200D基因则在大、小籽粒中均未检测到表达。【结论】BnEOD3基因仅有2个拷贝(BnaA04g27100D和BnaC04g50960D)在发育籽粒中检测到表达,其中BnaA04g27100D在第114碱基处的SNP变异导致氨基酸序列甘氨酸(G)与丙氨酸(A)的氨基酸的差异,可能与大、小籽粒性状有关。

分类号： S565.4

  • 相关文献

[1]甘蓝型油菜BnGS3和BnGhd7的同源克隆及其与油菜产量相关性状的关系. 薛志飞,王夏,李付鹏,马朝芝. 2018

[2]基于优化ACGM标记的甘蓝型油菜大籽粒材料聚类分析(英文). 俎峰,李静,罗延青,赵凯琴,马芳,陈苇,王敬乔,李劲峰,董云松. 2012

[3]基于优化ACGM标记的甘蓝型油菜大籽粒材料聚类分析. 俎峰,李静,罗延青,赵凯琴,马芳,陈苇,王敬乔,李劲峰,董云松. 2012

[4]油菜开花期的遗传调控及QTL研究进展. 李新,肖麓,杜德志. 2019

[5]油菜AP2/ERF家族转录因子的分离及其生物学功能. 庄静,熊爱生,彭日荷,陈建民,朱波. 2009

[6]油菜乙酰羟基酸合酶基因BnAHAS1的克隆及其重组蛋白质的原核表达. 胡茂龙,孔令娜,龙卫华,高建芹,浦惠明,戚存扣,张洁夫,陈松. 2014

[7]甘蓝型油菜KCS13基因克隆与组织表达特异性分析. 邢素娜,曹应龙,武玉花,吴刚,李均,卢长明. 2011

[8]油菜脂肪酸延长酶基因fae1片段的克隆与SNP分析. 肖玲,卢长明. 2005

[9]不同施肥技术对油菜苗期发棵的影响. 侯剑. 2000

[10]施用PL-2对油菜产量及主要性状的影响. 刘葛山,赵祥祥. 2004

[11]三个引进抗除草剂油菜品种植物学性状及经济性状的分析. 董云,张涛,王毅,漆燕玲. 2007

[12]栽培因素对油菜茎、分枝产量形成的影响. 赵继献,朱文秀,王华. 2000

[13]重庆油菜产业发展潜力和对策探讨. 唐晓华,易靖,王虹. 2017

[14]双低杂交油菜黔油20号稻田免耕直播栽培技术. 钟华义,熊国权,杨斌,杨春杰,饶勇. 2009

[15]白沙乡油菜凝冻灾害调查与减灾技术示范. 李娅,王沁,李昌明,华德富,李绍兵,唐容,林涛,饶勇. 2009

[16]提高油菜苗床出苗率研究. 侯国佐. 2000

[17]不同栽培方式对黔油28号产量及经济效益的影响. 杨斌,饶勇,肖华贵,李超. 2012

[18]油菜种植全程机械化不同品种适应性比较试验研究初探. 吴文平,魏忠芬. 2014

[19]宁杂1号亲本不同行比和密度对制种产量的影响. 童晓利,李刚华,赵荷娟,曹荣祥,张海军,蒋小平. 2000

[20]油菜在青海省种植的优势地位和开发前景. 田正科. 1999

作者其他论文 更多>>

微信小程序