云南当前种植地方稻种SSR遗传多样性分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 张恩来

作者： 张恩来;徐福荣;汤翠凤;阿新祥;杨雅云;董超;张斐斐;徐安虎;戴陆园

作者机构：

关键词： SSR;遗传多样性;地方稻种;当前种植;云南

期刊名称： 植物遗传资源学报

ISSN： 1672-1810

年卷期： 2011 年 12 卷 06 期

页码： 890-895

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 选用20对SSR引物对2007-2008年间从云南省56个县(区)收集的416份地方稻种进行遗传多样性分析。共检测到116个等位变异,每个位点变幅为3～13,平均为5.8个;SSR引物多态性信息含量PIC指数平均为0.681,最小为RM18的0.349,最大的RM6748为0.891;56个县的PIC变幅为0.025～0.679,平均为0.381,勐海县的PIC最高,广南县等仅有1份参试材料的8个县的PIC最低。聚类结果表明,在遗传一致度为0.362处将56个县的稻种分为3个类群,第Ⅰ类包括勐海等54个县,在阈值为0.499处又分为2个亚类,其中亚类Ⅰ-1包括36个县,亚类Ⅰ-2包括18个县,第Ⅱ类仅包括思茅区,第Ⅲ类仅包括河口县;楚雄州的牟定县与姚安县的遗传一致度最大,为0.943,大姚县与姚安县的遗传一致度也较高,为0.925,思茅区与宁蒗县的遗传一致度最小,为0.033,各县(区)的遗传一致度与地理位置有一定的相关性。本研究结果表明,云南当前种植的地方稻种具有丰富的遗传多样性,但分布很不均匀,遗传多样性主要集中在西双版纳、德宏、普洱、临沧和红河5个州市。

分类号： S511

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