基于转录组测序的油莎豆茎豆形成关键基因的挖掘与分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 郭晓阳

作者： 郭晓阳;余彦鸽;代丹丹;腊贵晓;理向阳;李彦鹏;王艳红;郭红霞;杨铁钢

作者机构：

关键词： 茎豆;差异表达基因;KEGG通路;转录因子

期刊名称： 甘肃农业大学学报

ISSN： 1003-4315

年卷期： 2024 年 59 卷 004 期

页码： 71-81

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 【目的】通过分析油莎豆匍匐茎与新茎豆的转录组数据，挖掘与油莎豆茎豆形成相关的基因，探究油莎豆茎豆形成的分子机制。【方法】以匍匐茎及新茎豆为研究对象，通过转录组比较分析，挖掘茎豆形成相关基因，富集KEGG代谢通路。【结果】与未膨大的匍匐茎相比，膨大后的新茎豆中筛选出差异表达基因2 126个，其中283个上调表达，1 843个下调表达。GO富集分析显示，主要集中在胚胎发育结束于种子休眠、细胞分裂、细胞核、叶绿体、GTP酶活性等GO terms。KEGG富集分析表明，DEGs主要富集到植物激素信号转导、淀粉和蔗糖代谢通路中。其中植物激素信号转导相关基因（生长素反应因子ARF11、稻草人2-like蛋白SCR、LRR受体样丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶At2g24230），淀粉和蔗糖代谢相关基因（葡聚糖内切-1,3-葡糖苷酶At2g27500、叶绿体异淀粉酶2 ISA2、含五肽重复序列蛋白At1g71460）在新茎豆中表达下调。上述基因可能是参与茎豆形成的相关基因。【结论】通过对新茎豆与匍匐茎进行转录组分析，挖掘出茎豆形成相关基因及代谢通路，为阐明茎豆形成的分子机制提供理论参考。

分类号： S565.9

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