基于高效SNP芯片的小麦产量相关性状全基因组关联分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 刘丽华

作者： 刘丽华;刘阳娜;周悦;李宏博;张明明;屈平平;赵昌平;庞斌双

作者机构： 北京市农林科学院杂交小麦研究所,杂交小麦分子遗传北京市重点实验室,农业农村部农作物DNA指纹创新利用重点实验室

关键词： 小麦;产量相关性状;关联分析;SNP芯片

期刊名称： 麦类作物学报

ISSN： 1009-1041

年卷期： 2023 年 43 卷 011 期

页码： 1404-1416

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 挖掘小麦产量相关性状的稳定关联位点,为相关基因克隆和分子标记辅助选择提供理论依据.本研究以248个中国北部冬麦区育成品种为材料,利用自主研发的Affymetrix BAAFS Wheat 90K SNP芯片对株高、穗长、小穗数、穗粒数、有效分蘖数、粒长、粒宽和千粒重共8个产量相关性状进行全基因组关联分析.共检测到158个与8个性状显著关联(P≤0.00001)的SNP位点,其中45个位点至少在两个环境中稳定表达,解释平均表型变异的3.60%~10.51%.在这45个位点中,有8个稳定关联位点与以往的研究结果一致;37个为新发现稳定位点,其中3个与株高稳定关联的位点,分布在7D染色体上,解释表型变异的3.60%~4.39%;9个与穗长稳定关联的位点,分别分布在1D、3A、5B和7D染色体上,解释表型变异的5.61%~8.42%;1个与穗粒数稳定关联的位点,分布在7D染色体上,解释表型变异的6.06%~7.22%;8个与有效分蘖数稳定关联的位点,分布在1B染色体上,解释表型变异的6.33%~8.73%;6个与粒长稳定关联的位点,分别分布在2A和5B染色体上,解释表型变异的5.45%~6.62%;7个与粒宽稳定关联的位点,分别分布在4B和5A染色体上,解释表型变异的6.90%~10.51%;3个与千粒重稳定关联的位点,分布在3A染色体上,解释表型变异的7.05%~7.69%;对稳定位点进行候选基因分析,筛选到45个候选基因,其中有功能注释的基因41个,其中4个位于基因内.

分类号： S512.1%S330

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