西瓜EST资源的SSR信息分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 赵胜杰

作者： 赵胜杰;刘文革;阎志红;何楠

作者机构：

关键词： 西瓜;EST;SSR信息

期刊名称： 中国蔬菜

ISSN： 1000-6346

年卷期： 2009 年 1 卷 24 期

页码： 47-51

收录情况： 北大核心

摘要： 对5034条西瓜无冗余EST序列进行了搜索,共检索出347个SSR,检出率为6.89%,平均分布距离为7.49kb。包括91种重复基元,其中二核苷酸和三核苷酸重复基元占主导地位,分别占总SSR的39.48%和46.68%。AT是二核苷酸中的优势基元,占二核苷酸重复类型的23.35%。三核苷酸重复基元分布比较分散,优势基元GAA仅占三核苷酸重复类型的8.64%。理论上表明这些EST-SSR具有较高的可用性。

分类号： S651

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