大豆胞囊线虫主效抗病基因Rhg4 (GmSHMT)的CAPS/dCAPS标记开发和利用

文献类型: 中文期刊

第一作者: 史学晖

作者: 史学晖;李英慧;于佰双;郭勇;王家军;邱丽娟

作者机构:

关键词: 大豆胞囊线虫;Rhg4;CAPS/dCAPS标记;单倍型;分子标记辅助选择

期刊名称: 作物学报

ISSN: 0496-3490

年卷期: 2015 年 41 卷 10 期

页码: 1463-1471

收录情况: CSCD

摘要: 大豆胞囊线虫(soybean cyst nematode, SCN)严重危害世界大豆生产, Rhg4 (resistance to Heterodera glycines 4)是控制大豆SCN抗性的2个主效位点之一。本研究针对Rhg4 (GmSHMT)上的2个单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms, SNP)位点开发了快速、经济、简便易行的CAPS (Rhg4-389)和dCAPS标记(Rhg4-1165), 并用开发的2个标记鉴定了以大豆胞囊线虫应用核心种质为主的193份代表性抗感种质。结果表明, Rhg4-389和Rhg4-1165位点间存在显著连锁不平衡(P=0.0001, r~2=0.87), 可形成4种单倍型。Rhg4-389-G/Rhg4-1165-T和Rhg4-389-C/Rhg4-1165-A为优势单倍型, 稀有单倍型Rhg4-389-G/Rhg4-1165-A和Rhg4-389-C/Rhg4-1165-T是在中国抗源中新发现的单倍型。结合193份种质对SCN3号小种抗性鉴定分析发现, Rhg4-389-G和Rhg4-1165-T主要存在于抗病种质, 它们形成的单倍型对抗病种质鉴定效率可达94.1%。本研究开发了可用于辅助大豆SCN抗性鉴定且方便育种家利用的CAPS/dCAPS标记, 且用其摸清了应用核心种质等重要抗源在Rhg4位点的“本底”, 为育种家有效利用这些优异抗源提供了重要信息。

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