陆地棉LTR反转录转座子的数量分布与功能分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 刘震

作者： 刘震;刘震;卢全伟;张国强;彭仁海

作者机构：

关键词： 陆地棉;LTR反转录转座子;分布;功能

期刊名称： 河南师范大学学报(自然科学版)

ISSN： 1000-2367

年卷期： 2017 年 45 卷 06 期

页码： 72-78

收录情况： 北大核心

摘要： LTR(Long terminal repeat)反转录转座子是真核生物基因组中普遍存在的一类遗传因子,它们以RNA为媒介在基因组中不断自我复制.在高等植物中,LTR反转录转座子是基因组的重要成分之一.本研究通过多种方法挖掘并注释了陆地棉基因组中的LTR反转录转座子,结果表明陆地棉基因组LTR反转录转座子的Gypsy超家族与基因的分布呈近似的反比关系,而Copia超家族在各染色体的起始端有较多的分布.通过皮尔森相关系数发现陆地棉LTR反转录转座子的拷贝数与染色体大小之间有强相关性.在LTR反转录转座子上游和下游分布的基因具有类似的富集特征,其分子功能主要集中在结合和催化活性等方面.本研究结果加深了对陆地棉LTR反转录转座子的认识,为深入研究棉花基因组提供了重要数据支撑.

分类号： Q943.2`S562

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