Hi-Meth:特定位点DNA甲基化高通量检测平台

文献类型： 中文期刊

第一作者： 李慧颖

作者： 李慧颖;刘庆;郭旻;王克剑;严长杰;王春

作者机构：

关键词： 5-甲基胞嘧啶;甲基化特异位点检测;高通量测序平台;Hi-Meth

期刊名称： 生物工程学报

ISSN： 1000-3061

年卷期： 2022 年 38 卷 008 期

页码： 3049-3061

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 胞嘧啶甲基化是DNA表观遗传修饰的主要类型之一,在维持正常细胞功能和调控基因表达中具有重要作用.重亚硫酸盐测序法(bisulfite sequencing PCR,BSP)是特异性位点DNA甲基化检测的通用方法,能明确目的片段中每一个CpG位点的甲基化状态,但此方法需要大量的单克隆测序,操作过程较繁琐、成本昂贵.因此,开发准确、高效、便捷的DNA甲基化检测技术对提升表观遗传研究效率具有重要意义.基于本课题组开发的高通量突变类型检测平台Hi-TOM(high-throughput tracking of mutations),我们进一步建立了特定位点DNA甲基化高通量检测平台Hi-Meth(high-throughput detection of DNA methylation).DNA 样品通过重亚硫酸盐处理之后,仅需一轮PCR扩增即可通过Hi-Meth平台获得特定位点DNA甲基化分析结果.利用Hi-Meth平台,对水稻不同基因启动子区域进行了 DNA甲基化检测分析,并与基于BSP方法获得的结果进行了比较.结果 表明,Hi-Meth策略与BSP策略检测结果基本一致.而且通过Hi-Meth平台可以更准确、便捷地获得特异性位点DNA甲基化分析结果.综上所述,Hi-Meth为特定DNA区域提供了重要的甲基化检测平台,对表观遗传研究具有重要意义.

分类号： Q75

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