基于EST和GSS序列的巨桉miRNA研究

文献类型： 中文期刊

第一作者： 李崇奇

作者： 李崇奇;沈文涛;言普;黎小瑛;周鹏

作者机构：

关键词： 巨桉;miRNA;EST;GSS

期刊名称： 热带作物学报

ISSN： 1000-2561

年卷期： 2014 年 35 卷 06 期

页码： 1108-1116

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 应用miRtour在线分析工具对巨桉的EST序列和GSS序列进行分析,预测巨桉的miRNA序列,应用psrobot预测miRNA的靶基因。结果发现205条miRNA前体序列和属于62个不同家族的170条成熟的miRNA序列,最大的miRNA家族为miR399家族,有17个成员;miRNA 5′段碱基存在明显的碱基偏倚,尿嘧啶出现频率高达40.6%;147个miRNA预测到了靶基因,共计预测到巨桉蛋白基因中有967个受到miRNA的调节,同时发现1个miRNA可以调控多个靶基因,同一蛋白质受多个miRNA调控的现象。

分类号： S792.39

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