传统发酵乳源短乳杆菌HQ1-1基因组特征与糖代谢表型分析

文献类型: 中文期刊

第一作者: 吴青海

作者: 吴青海;三月;萨初拉;郭煜;王力伟;王莉梅;杨静;其布日

作者机构:

关键词: 传统发酵乳;短乳杆菌HQ1-1;全基因组测序;功能基因;糖代谢表型

期刊名称: 食品与发酵科技

ISSN: 1674-506X

年卷期: 2024 年 60 卷 006 期

页码: 1-7,21

摘要: 该文探究传统发酵乳源短乳杆菌(Lactobacillus brevis)HQ1-1的基因组基本特征和糖代谢表型。经PacBio平台对短乳杆菌HQ1-1进行全基因组测序,并对基因组进行功能分类和注释。结果显示,短乳杆菌HQ1-1包含1条长度为2 376 708 bp的环状染色体和7个大小不同的质粒DNA,编码2 268个基因。通过KEGG数据库注释到参与代谢过程的基因有860个,其中,碳水化合物代谢相关基因的数量为142个,占比为16.51%。进一步用CAZy数据库注释到了糖苷水解酶类基因114个,占碳水化合物相关基因总数的45.24%。通过OmniLog微阵列表型芯片分析发现,短乳杆菌HQ1-1对L-阿拉伯糖、D-木糖、D-核糖、L-来苏糖等碳源的利用效率相对更高。因此,发酵乳源短乳杆菌HQ1-1基因组中包含碳水化合物代谢相关基因的数量较多,能够利用多种碳源。该文全面阐述了短乳杆菌HQ1-1基因组特征和代谢表型,为今后开发功能性发酵食品提供新型乳酸菌发酵剂。

分类号: TS252.1

  • 相关文献

[1]水稻外源DNA导入变异系与受体的农艺性状差异及其基因变异分析. 胡远艺,彭彦,毛毕刚,王津津,赵炳然. 2013

[2]高质量竹黄菌全基因组DNA的提取方法比较. 黄青青,乙引,魏洪美,任锡毅,刘永翔. 2015

[3]一株分离自鸡肉样品的多重耐药大肠埃希菌的全基因组测序及耐药性研究. 常江,罗怡,唐标,张玲,戴贤君,裘罕琦,杨华,夏效东. 2019

[4]吲哚放线杆菌AIFJ1607株全基因组测序及耐药特性分析. 车勇良,陈秋勇,陈如敬,吴学敏,王隆柏,刘玉涛,周伦江. 2021

[5]紫芝栽培品种‘武芝2号’(‘紫芝S2’)全基因组测序及分析. 陈体强,徐晓兰,石林春,钟礼义. 2021

[6]抗病毒转基因大豆事件外源T-DNA序列分析及定性检测. 刘东波,邢国杰,赵倩倩,杨静,牛陆,杨向东,仲晓芳. 2020

[7]牛源乳腺致病性大肠杆菌JL05全基因测序及毒力和耐药基因分析. 曲星霖,肖丹,吴健,马晓媛,白翠,王妍,王楠. 2020

[8]山羊地方性鼻内肿瘤病毒ENTV-2FJ株的分离纯化和全基因组序列分析. 江锦秀,林裕胜,张靖鹏,游伟,黄丽丽,毛坤明,胡奇林. 2020

[9]山羊内源性鼻内肿瘤病毒enENTV-FJ1株全基因组测序及生物信息学分析. 江锦秀,张靖鹏,林裕胜,毛坤明,游伟,黄丽丽,胡奇林. 2020

[10]引起芭蕉芋细菌性软腐病的玉米迪基氏菌(Dickeya zeae)CE1的全基因组序列及比较基因组学分析. 张景欣,沈会芳,蒲小明,孙大元,杨祁云,林壁润. 2020

[11]海产源多重耐药共生菌的耐药表型及耐药基因分析. 吴书香,李丽倩,姚琳,王联珠,曲梦,李风铃,谭志军,江艳华,王鹏. 2023

[12]固氮斯氏假单胞菌A1501的PST1305(arsC)基因遗传进化及表达调控的研究. 樊慧俐,窦岳坦,燕永亮,平淑珍,林敏. 2008

[13]1株ST515型多重耐药单增李斯特菌全基因组测序分析. 杜冬冬,钱晶,常恒瑞,李红敏,魏向利,刘长勇,罗瑞峰,王国红,康立超. 2024

[14]猪戊型肝炎病毒黑龙江分离株SWHLJ-BXBX全基因组序列的测定与分析. 李海,王刚,张交儿,何希君,刘永刚,姜成刚,王淑杰,涂亚斌,蔡雪辉. 2017

[15]出芽短梗霉菌株PA-2全基因组测序及分析. 高汉峰,刘晓芳,程亮,朱海霞,杨琼英,张纲,刘玉玲,郭青云. 2021

[16]发酵蔬菜来源具抑菌活性明串珠菌的筛选及其细菌素基因簇挖掘. 刘毕琴,陈骏飞,罗义勇,赵勇,万幸,蔡英丽,唐蓉,史巧,李宏. 2024

[17]鸽新城疫病毒BJ-C分离株基因组测序及系统发育分析. 韩坤,梁琳,李复煌,梁瑞英,汤新明,丁家波. 2022

[18]吉林地区高致病性PRRSVJL-04/12株的分离鉴定与全基因组测序. 王凤雪,郭利,温永俊,宋妮,杨艳玲,张淑琴,谭斌,武华. 2013

[19]杨梅全基因组测序结果初报. 戚行江,任海英,梁森苗,郑锡良,吴阳春. 2015

[20]耐辐射戈壁异常球菌基因组和转录组分析. 袁梦龙,赵鹏,张维,林敏,陈明. 2013

作者其他论文 更多>>