甘蓝型油菜低温诱导下的bZIP转录因子挖掘及聚类分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 杜春芳

作者： 杜春芳;刘春晴;咸拴狮;范建春;胡恺宁;李萌;涂金星;傅廷栋

作者机构：

关键词： 甘蓝型油菜;低温;bZIP转录因子;挖掘;聚类分析

期刊名称： 植物遗传资源学报

ISSN： 1672-1810

年卷期： 2016 年 17 卷 01 期

页码： 153-161

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 植物响应低温胁迫的过程是一个复杂的网络过程,涉及众多转录因子的调控。本文通过对低温胁迫下的甘蓝型油菜转录组数据进行生物信息学分析,获得108个序列编码bZIP转录因子。经过序列比对、染色体定位和聚类分析,发现这些转录因子定位在19条染色体上,在抗寒过程中表现动态变化;同时发现这些转录因子在A亚族、C亚族、I亚族、G亚族、S亚族中聚集最多,B亚族和D亚族中很少聚集;取4个在所有胁迫阶段皆表现差异的基因进行定量分析,发现其调控变化与测序分析的变化趋势相同,不仅证明了测序数据的可靠性,而且证明甘蓝型油菜bZIP转录因子对低温胁迫的响应是一个动态的调控过程。

分类号： S565.4

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