甘蓝型油菜低温诱导下的bZIP转录因子挖掘及聚类分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 杜春芳

作者： 杜春芳;刘春晴;咸拴狮;范建春;胡恺宁;李萌;涂金星;傅廷栋

作者机构：

关键词： 甘蓝型油菜;低温;bZIP转录因子;挖掘;聚类分析

期刊名称： 植物遗传资源学报

ISSN： 1672-1810

年卷期： 2016 年 17 卷 01 期

页码： 153-161

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 植物响应低温胁迫的过程是一个复杂的网络过程,涉及众多转录因子的调控。本文通过对低温胁迫下的甘蓝型油菜转录组数据进行生物信息学分析,获得108个序列编码bZIP转录因子。经过序列比对、染色体定位和聚类分析,发现这些转录因子定位在19条染色体上,在抗寒过程中表现动态变化;同时发现这些转录因子在A亚族、C亚族、I亚族、G亚族、S亚族中聚集最多,B亚族和D亚族中很少聚集;取4个在所有胁迫阶段皆表现差异的基因进行定量分析,发现其调控变化与测序分析的变化趋势相同,不仅证明了测序数据的可靠性,而且证明甘蓝型油菜bZIP转录因子对低温胁迫的响应是一个动态的调控过程。

分类号： S565.4

  • 相关文献

[1]不同甘蓝型油菜抗耐低温冷(冻)生理指标可溶性糖含量的研究. 秦信蓉,喻时周,邹芳,沈奇,杜才富,赵云,张宁洁. 2013

[2]甘蓝型油菜耐低温发芽种质资源鉴定. 朱吉风,张俊英,杨立勇,蒋美艳,江建霞,李延莉,王伟荣,周熙荣. 2019

[3]甘蓝型油菜耐低温生长生理生化响应机制. 闫蕾,曾柳,吕艳,丁晓雨,程勇,占强,王小燕,鲍五洲,李小芳,邹锡玲. 2021

[4]8个油菜品种的耐低温萌发特性及其春播试验. 朱吉风,周熙荣,江建霞,张俊英,李延莉,杨立勇,王伟荣,蒋美艳. 2023

[5]花期低温阴雨对甘蓝型油菜产量和种子含油量的影响. 涂玉琴,戴兴临. 2011

[6]甘蓝型油菜及其二倍体祖先种COR413家族基因生物信息学分析. 袁淑培,张付贵,黄倩,程希,高桂珍,伍晓明. 2019

[7]甘蓝型油菜亲本遗传差异与杂种优势表现. 陈锋,张洁夫,张维,付三雄,陈松. 2016

[8]甘蓝型油菜Ogura胞质雄性不育系及恢复系聚类分析. 罗延青,俎峰,周丕才,张国建,王敬乔,董云松. 2012

[9]甘蓝型油菜亲本材料的综合评价和聚类分析. 宋来强,贺兴文. 1990

[10]西藏甘蓝型油菜种质资源品质性状的聚类分析. 李施蒙. 2019

[11]甘蓝型油菜种质资源的农艺性状聚类分析. 丁厚栋,张尧锋,余华胜,林宝刚,张冬青. 2009

[12]基于优化ACGM标记的甘蓝型油菜大籽粒材料聚类分析(英文). 俎峰,李静,罗延青,赵凯琴,马芳,陈苇,王敬乔,李劲峰,董云松. 2012

[13]基于优化ACGM标记的甘蓝型油菜大籽粒材料聚类分析. 俎峰,李静,罗延青,赵凯琴,马芳,陈苇,王敬乔,李劲峰,董云松. 2012

[14]国外甘蓝型油菜种质资源农艺性状和品质性状的聚类分析. 林宝刚,丁厚栋,张尧锋,余华胜,张冬青. 2010

[15]基于InDel标记的春油菜品种指纹图谱构建和杂交种纯度鉴定. 何鸟飞,赵绪涛,李开祥. 2025

[16]植物bZIP转录因子的研究进展. 杨颖,高世庆,唐益苗,冶晓芳,王永波,刘美英,赵昌平. 2009

[17]bZIP转录因子在植物生长发育及非生物逆境响应的作用. 刘慧洁,徐恒,邱文怡,李晓芳,张华,朱英,李春寿,王良超. 2019

[18]芹菜bZIP转录因子基因AgbZIP16的逆境响应分析. 沈迪,陈龙正,陶建平,刘洁霞,冯凯,尹莲,徐志胜,熊爱生. 2019

[19]大豆响应涝害bZIP基因Glyma04g04170的生物信息学分析及互作蛋白预测. 林延慧,唐力琼,徐靖,朱红林,王新华,王敏芬,徐冉,王效宁. 2020

[20]小麦bZIP家族转录因子的鉴定及其在盐胁迫条件下的表达分析. 毕晨曦,杨宇昕,于月华,李丹萍,史峰,马亮,孔秀英,张立超,倪志勇. 2021

作者其他论文 更多>>

微信小程序