基于SSR分子标记数据构建割手密核心种质库

文献类型： 中文期刊

第一作者： 徐超华

作者： 徐超华;刘新龙;毛钧;刘洪博;林秀琴;陆鑫;苏火生

作者机构：

关键词： 割手密;聚类;多样性指数;分子标记;核心种质

期刊名称： 湖南农业大学学报(自然科学版)

ISSN： 1007-1032

年卷期： 2020 年 46 卷 006 期

页码： 657-663

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 以92份割手密初级核心种质为研究对象,利用SSR分子标记数据,依据Jaccard、SM和Nei&Li 3种遗传相似性系数逐步进行UPGMA聚类、多次抽样构建割手密核心种质库.结果显示:92份样本在15个SSR位点上呈现出丰富的多态性,共获得331个多态性条带,平均多态性条带比例达100%;利用3种遗传相似性系数和随机取样共获得5个核心种质库;Shannon-Wiener多样性指数、总条带数和多态性条带数3个指标在核心种质库代表性检验中呈现出较高的检测效率,其他6个指标检测效率相对较低;5个核心库中依据SM遗传相似性系数逐步构建的核心种质库质量最优,该库由80份样本组成,Nei's多样性指数和Shannon?Wiener多样性指数分别为0.9841和4.2598,在P<0.05概率条件下与原库(分别为0.9856和4.3583)无显著差异,而且与原库的农艺性状均值差异百分率为0(<20.00%),极差符合率为99.16%(>80.00%).研究认为,依据SM相似性系数,通过UPGMA聚类构建的80份割手密核心种质较好地代表了基础原始种质的分子水平和表型遗传多样性,可为后续割手密种质资源的精准鉴定、优异抗性基因发掘和种质资源杂交利用提供依据.

分类号： S566.102.4

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