百脉根Hsp70s基因家族的生物信息学分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 杨芳

作者： 杨芳;杨仕梅;罗雪;吴佳海;宋莉

作者机构：

关键词： 百脉根;LiHsp70s基因结构;热激蛋白;生物信息学;功能预测

期刊名称： 山地农业生物学报

ISSN： 1008-0457

年卷期： 2020 年 39 卷 005 期

页码： 1-8

摘要： 热激蛋白(HSPs)是细胞受逆境诱导产生的一类具有稳定蛋白质结构、修复变性蛋白和维护生物膜稳定等功能的分子伴侣,同时,在缓解植物高温伤害和提高热耐受性等方面有重要的调控作用.根据百脉根基因组数据,利用生物信息学方法对百脉根Hsp70基因(LjHsp70s)家族的基因结构、染色体分布、选择压力、顺式作用元件、表达特性和系统进化等进行分析.结果表明,LjHsp70s家族有18个成员,分为4类,它们的内含子和外显子数量为1~8,含有多个保守基序,分布在6条染色体上,编码602~703个氨基酸,均编码酸性亲水蛋白;含有激素、光照及胁迫等响应顺式作用元件,LjHsp70s在百脉根的根、茎、叶等部位均有表达,但其表达量不同;该家族基因在进化过程中主要受负选择作用,进化上较为保守,家族成员与拟南芥和烟草的Hsp70基因可分为6组,但是百脉根LjHsp70s基因仅存在于4个亚族中,表明其与拟南芥、烟草的Hsp70s基因家族成员之间进化关系密切,同时也存在一定差异.LjHsp70s基因在百脉根的各个部位均有表达,对百脉根生长发育过程起着重要的作用,研究结果为解析百脉根LjHsp70s基因功能提供了依据.

分类号： Q811.4

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