土壤中立枯丝核菌AG3菌核的荧光定量PCR快速检测

文献类型： 中文期刊

第一作者： 申永铭

作者： 申永铭;郭成瑾;王喜刚;沈瑞清;陈爱昌;胡小平

作者机构：

关键词： 实时定量PCR;水筛法;马铃薯黑痣病

期刊名称： 菌物学报

ISSN： 1672-6472

年卷期： 2017 年 36 卷 10 期

页码： 1383-1391

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 立枯丝核菌Rhizoctonia solani融合群3(anastomosis group 3,AG3)是引发马铃薯黑痣病的主要病原菌,严重威胁着马铃薯产业的发展。菌核是马铃薯黑痣病菌在土壤中的主要存活结构,是马铃薯黑痣病的初侵染源,其密度直接影响马铃薯黑痣病的发病率和严重程度。为快速准确地检测出土壤中菌核的密度,本研究以立枯丝核菌AG3转录间区(ITS)特异性引物RsTqF1/RsTqR1扩增产物的重组质粒为标准品,构建SYBR Green I实时定量PCR(q PCR)检测体系,结合水筛法与Fast DNA?Spin Kit for Soil土壤DNA提取试剂盒对土壤样品进行DNA提取,建立了循环域值(Ct)与土壤中立枯丝核菌AG3菌核密度的关系,并与传统选择性培养基筛选法进行比较。结果表明,实时定量PCR检测灵敏度比常规PCR高10倍,土壤中菌核密度n(g/g土)和Ct值之间的关系为:n=10(9.6917‐Ct)/3.4558。相比较于选择性培养基筛选法,水筛q PCR法能够更加快速准确地检测出土壤中立枯丝核菌的菌核密度。

分类号： S435.32

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