谷子GRF基因家族鉴定与分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 张立全

作者： 张立全;张浩林;李丛丛;姚磊;魏建华;张杰伟

作者机构：

关键词： 谷子;GRF;基因家族;进化分析;磷酸化

期刊名称： 西南农业学报

ISSN： 1001-4829

年卷期： 2021 年 011 期

页码： 2340-2347

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 【目的】系统分析谷子GRF基因家族在谷子中如何发挥作用。【方法】基于谷子基因组数据库和生物信息学方法,鉴定谷子GRF基因家族的基因结构、基本特征、编码蛋白结构和潜在的磷酸化位点,并以序列比对进行系统进化分析。【结果】谷子含有10个GRF基因,含有2～4个外显子,分布于谷子第1、2、4、7、8和9号染色体上。MEME保守基序分析显示,谷子GRF蛋白均含有保守的QLQ（PF08880）和WRC（PF08879）结构域。磷酸化位点分析表明谷子GRF蛋白均含有大量的潜在磷酸化位点。【结论】为今后揭示谷子GRF蛋白的功能及其翻译后修饰提供重要参考。

分类号： S515

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