甘蔗细胞色素b6-f复合体铁硫亚基(SoCYT)基因的克隆和表达分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 梁潘霞

作者： 李杨瑞

作者机构：

关键词： 甘蔗;细胞色素b6-f复合体铁硫亚基;克隆;生物信息学分析;表达

期刊名称： 西南农业学报

ISSN： 1001-4829

年卷期： 2016 年 29 卷 05 期

页码： 1032-1037

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 以甘蔗叶片总RNA为模板,通过RT-PCR扩增细胞色素b6-f复合体铁硫亚基基因的c DNA,采用生物信息学软件分析所克隆基因的编码蛋白特性,并用荧光定量PCR分析该基因的表达情况。结果表明:克隆得到的c DNA片段长度为796 bp,包括1个579 bp的开放阅读框,编码192个氨基酸。甘蔗与高粱CYT基因c DNA序列的同源性为94.0%,氨基酸序列同源性为99.0%;该基因推导的蛋白分子量大小为20.67KD,等电点为6.24,疏水性分值在0.50~2.11;蛋白二级结构中α-螺旋占17.19%,随机卷曲占53.12%,延伸链占21.53%,β-转角只占8.33%,Gen Bank登录号为JQ712582。实时荧光定量分析结果表明,随着甘蔗干旱胁迫时间的延长,So CYT基因表达均呈下降的趋势,PEG与PEG加Si处理的So CYT基因的表达量有显著差异,加硅可减缓So CYT基因表达的下降速度和对细胞色素b6/f复合体的结构的损伤和影响。

分类号： S566.1

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