利用SSR荧光标记构建山楂种质分子身份证

文献类型： 中文期刊

第一作者： 秦宇

作者： 秦宇;郭荣琨;农惠兰;王燕;崔凯;董宁光

作者机构：

关键词： 山楂;种质资源;SSR荧光标记;分子身份证

期刊名称： 园艺学报

ISSN： 0513-353X

年卷期： 2024 年 06 期

页码： 1227-1240

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 以91份山楂种质资源为材料，使用SSR标记对其进行分子身份证构建，并进行遗传多样性分析。从山楂基因组数据库中开发并设计了96对引物，筛选出了12对多态性好的引物，利用SSR荧光标记毛细管电泳技术检测扩增条带的分子量，并分析参试样品的扩增带型。采用数字与字母组合的方式，依据12对引物的多态性信息含量由高到低排列引物扩增结果，生成各材料的指纹编码。基于非加权组平均法（unweighted pair-group method with arithmetic means,UPGMA）对91份山楂资源进行聚类分析。结果表明，12对SSR引物从91个山楂种质资源样品中共扩增到67个等位基因，其平均等位基因数、有效等位基因数、观测杂合度、期望杂合度分别为5.583、2.730、0.490、0.593,Shannon’s信息指数平均值为1.195，多态性信息含量介于0.300～0.715之间，平均为0.551。91份山楂资源的遗传相似系数范围为0.25～0.98，平均值为0.529，在遗传相似系数0.46处时可分为5大类群。根据引物的多态性信息含量高低选择引物组合，构建了山楂种质区分需要的最少引物组合。

分类号： S661.5

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